荷花SBP基因家族分析与克隆鉴定开题报告

 2022-01-26 11:04:51

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

荷花是重要的观赏花卉之一。

与拟南芥和玉米相比,荷花中基因家族的研究虽然已经有所报道,可是相对滞后。

2013年,荷花基因组草图先后被测序完成。

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2. 研究的基本内容和问题

在本研究中,利用生物信息学资源和工具,对荷花中的sbp-box基因家族进行了比较分析。

利用多个物种的基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树。

在系统发生树的末端节点上鉴定出对旁系同源基因。

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3. 研究的方法与方案

在tair数据库中获得拟南芥中已知的sbp-box家族基因编码的蛋白质序列。

利用pfam软件预测这些蛋白质中包含的sbp结构域。

再利用这些sbp结构域区段序列作为检索序列,使用blastp搜索tigr拟南芥注释数据库和tigr水稻基因组注释数据库。

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4. 研究创新点

在本研究中,利用生物信息学资源和工具,对荷花中的SBP-BOX基因家族进行了比较分析。

利用多个物种的基因编码的蛋白质序列构建了系统发生树

5. 研究计划与进展

以荷花为实验材料,深入研究荷花SBP基因家族,并构建关键SBP基因的过表达载体,为后续研究SBP基因家族功能提供基础。

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