梨PFK基因家族生物信息学及表达分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1. 本课题的意义

梨，是我国最重要的经济作物之一，梨果鲜美,肉脆多汁,酸甜可口,风味芳香优美。富含糖、蛋白质、脂肪、碳水化合物及多种维生素,对人体健康有重要作用。我国是梨属植物中心发源地之一,梨品质的提高对我国经济发展有重要的意义。而对果实的品质的改善提高经济效益的重要手段，果实的含糖量是果实品质的重要因素，对影响糖分因素的研究有重要的意义。

糖酵解是除了蔗糖山梨醇之外的碳水化合物的主要代谢途径。磷酸果糖激酶（pfks）包括atp供体的fru-6-p1-磷酸果糖激酶(pfk，ec2.7.1.11)，和焦磷酸供体的fru-6-p1-磷酸转移酶(pfp，ec2.7.1.90)^[1][11]，pfk中包括pfk1和pfk2，分别将6磷酸果糖催化成为果糖1,6-二磷酸和果糖2,6-二磷酸，pfp催化6磷酸果糖成为果糖1,6-二磷酸。

2. 研究的基本内容和问题

1. 研究的目标、内容

pfk(磷酸果糖激酶)是植物体内参与果实糖代谢，调节糖酵解的速度的重要酶。其活性与植物体内代谢及蔗糖的积累密不可分，所以对该基因家族的研究很有必要。对拟南芥中pfk基因家族的研究，而其基因家族在梨中的功能分化，家族进化及表达分析研究尚浅。该实验通过软件分析以及实验验证，包括基因家族的筛选、分类、基因结构、进化分析、表达分析等，完善梨中pfk基因家族的全基因分析体系，为进一步的研究提供可靠的数据基础。

2. 拟解决的关键问题

3. 研究的方法与方案

1. 研究方法

利用各类可靠的生物软件和生物数据库进行生物信息学分析。

利用转录组数据及半定量对各组织表达的分析，分析pfk基因家族在梨中的特异性表达。

4. 研究创新点

创新之处

（1）PFK和PFP是糖酵解途径中的关键酶，与糖的形成很大的关系，但在果树中的研究还较少，其所所构成的PFKs基因家族在梨中的分析还没有研究。

5. 研究计划与进展

研究计划及预期进展

一、前期准备：