石榴果香发育关键基因生物信息学研究开题报告

1. 研究目的与意义

石榴作为具有已公布基因组数据的重要果树物种，具有重要的果树生物学和进化生物学研究价值。

创新性进化是物种分化的重要驱动因素，有些进化创新是一个完整植物类群的决定性特征。

果实香气发育就是其中的主要创新之一。

2. 国内外研究现状分析

石榴(punica granatum)是千屈菜科(lythraceae)石榴属(punica l.)落叶果树，起源中亚，是古老的保健水果，被誉为超级水果（苑兆和, 2015）。

石榴栽培历史悠久，适应性强，在世界范围内广泛栽培，被划为国家规划特色经济林树种之一（苑兆和, 2016）。

我国现有石榴品种资源约200多个，分布南北各地20多个省区。

3. 研究的基本内容与计划

1.石榴转录谱选用石榴成熟果实的果皮，采用参考文献提取总 rna。

构建双末端 rna-seq 文库，并根据 illumina 操作说明（illumina,usa）使用 illumina hiseq 4000 平台进行测序。

使用 ngsqctoolkit （v2.3.3）软件进行原始读长（read)，对原始数据进行质控，过滤掉 不完整序列、重复序列、接头序列、载体序列。

4. 研究创新点

果香是果实成熟的重要标志之一，具有物种特异性，研究不同物种果实香气发育过程可以理解物种分化的进化创新。

本课题组通过构建果香代谢基因调控网络，分析WGD对该网络的影响，重建果香进化场景，为理解和进一步研究石榴的果香调控和植物进化提供资源。