假单胞菌噬菌体的筛选、鉴定及回收率检测开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

课题的意义

病毒是地球上最丰富的生物实体，对土壤中营养元素的生物地球化学循环、微生物群落组成以及土壤基因资源的多样性发挥着重要作用。目前已知土壤中含有大量的噬菌体（10⁷-10⁹gdw^-1），其数量是共生细菌的10-1000倍^［1］。这种未被发现的多样性不仅可能导致对新噬菌体物种的新发现，而且其特性也可能导致其在全球生物地球化学循环和陆地生态系统中有关功能的大发现。

尽管具备这样的生态学价值，但由于其个体微小、基因组含量低、进化速度快生命周期短等特点，土壤病毒生态学的研究进展缓慢。另一个原因是土壤的微观异质性、有机抑制剂的存在干扰了许多分子生物技术的应用以及缺乏适合的筛选工具等多方面因素共同导致的有关噬菌体分离的技术困境^［2］。病毒对土壤的吸附与病毒种类、土壤ph值、温度、含水量、土壤结构等环境因子密切相关。土壤病毒学研究的第一步是选择合适、高效的提取方法高效地提取出吸附于土壤颗粒表面的病毒粒子^［3］。以此为出发点因此, 建立一套价格适宜、普通实验室均可操作并且快速、简单、结果重现性良好的从土壤中提取病毒的方法对研究病毒在土壤中的行为和去向非常必要。

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标

细菌噬菌体具有较为专一的寄生和裂解宿主细菌的特性，是生物地球化学循环的重要驱动者，同时也是土壤微生物群落结构及功能的重要调控者。一种具有广泛适用性、操作简单、可重复性强的噬菌体筛选方法将为噬菌体的生态功能研究、理论模型构建以及应用开发奠定基础。

内容

3. 研究的方法与方案

研究方法

一、噬菌体的分离纯化及初步鉴定

1.制备土壤浸提液

4. 研究创新点

使用透射电镜，磷钨酸负染法观察噬菌体，确定提取所得噬菌体的科分类

5. 研究计划与进展

计划于计划于2019年12月24日前完成第一阶段，即土壤样品中宿主菌种类的鉴定和筛选。

在2020年2月份前完成筛选方法的确定

于2020年开学之后完成后续实验