1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
本实验主要研究ago2互作蛋白在植物抗病中的生物学功能,我们发现在拟南芥上接种病原菌即丁香假单胞番茄致病变种(pseudomonassyringae-pv.tomato,pst)后,ago2与mir393b*结合形成诱导沉默复合体,进而调控植物抗病。我们通过lc-ms/ms和co-ip技术来鉴定与ago2互作的蛋白,在分析了表达谱和测序结果后,挑选了表达差异显著的蛋白amc1(arabidopsistype1metacaspases)来进行后续的研究实验。
1.hutvagnerg,simardmj.(2008).argonauteproteins:keyplayersinrnasilenceingnat.rev.mol.cellbiol9,22-32.
2.jinhl.(2008).endogenoussmallrnasandantibacterialimmunityinplants.febsletters582,2679-84.
2. 研究的基本内容和问题
通过LC-MS/MS和CO-IP技术筛选鉴定与AGO2互作的蛋白,克隆并构建35S:Flag-AMC1和35S:HA-AGO2表达载体,在本氏烟中验证两者的互作。在拟南芥中检测AMC1和AGO2两者表达量的相互关系。确定AMC1和AGO2的互作结构域。检测过表达amc1和amc1突变体的抗病能力。病原菌侵染拟南芥,分析检测AMC1表达量的变化及对AMC1和AGO2两者互作的影响。最后检测AMC1对AGO2结合的小RNA表达量的影响。
3. 研究的方法与方案
通过LC-MS/MS和CO-IP技术筛选鉴定与AGO2互作的蛋白,克隆并构建35S:Flag-AMC1和35S:HA-AGO2表达载体,在本氏烟中验证两者的互作。在拟南芥中检测AMC1和AGO2两者表达量的相互关系。确定AMC1和AGO2的互作结构域。检测过表达amc1和amc1突变体的抗病能力。病原菌侵染拟南芥,分析检测AMC1表达量的变化及对AMC1和AGO2两者互作的影响。最后检测AMC1对AGO2结合的小RNA表达量的影响。
4. 研究创新点
本实验主要研究AGO2互作蛋白在植物抗病中的生物学功能,我们发现在拟南芥上接种病原菌即丁香假单胞番茄致病变种(Pseudomonassyringae-pv.tomato,Pst)后,AGO2与miR393b*结合形成诱导沉默复合体,进而调控植物抗病。我们通过LC-MS/MS和CO-IP技术来鉴定与AGO2互作的蛋白,在分析了表达谱和测序结果后,挑选了表达差异显著的蛋白AMC1(Arabidopsistype1metacaspases)来进行后续的研究实验。
5. 研究计划与进展
研究材料:拟南芥、本氏烟
技术路线:
1)目的基因amc1的克隆
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