1. 研究目的与意义
松材线虫病又称松树萎蔫病，是松树的一种毁灭性流行病。本研究旨在验证和利用gSSR标记和EST-SNP标记的方法分析我国不同来源松材线虫虫株的多样性，探寻其间的亲缘性，并分析可能传播路径，从而为确定新疫点松材线虫的可能来源，加强源头疫木的处理奠定理论和实践基础。
2. 国内外研究现状分析
metge等采用rapd与issr对来自美国、加拿大、日本、中国、韩国及葡萄牙的30个松材线虫虫株进行了研究并进行聚类分析。
he等(2009)利用长筒石蒜的est-ssr开发了18个ssr标记，这些标记将被用于遗传结构和种群多样性的研究。
cheng等采用aflp对中国线虫进行研究，并讨论了松材线虫种群在中国传播过程中遗传多样性的变化。
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3. 研究的基本内容与计划
1. 松材线虫多态性分子标记的开发（2012.2.13~4.30）
利用松材线虫全基因组数据及est数据及相关生物信息学手段搜索得到的ssr、snp位点，利用primer 5及assay design sw2.0软件设计引物并进行常规pcr扩增。选择部分不同地理来源的松材线虫单条线虫进行全基因组扩增，用以验证ssr位点多态性；利用松材线虫dna pool验证snp位点多态性。
2. 我国不同地理来源松材线虫遗传多样性分析（2012.4.30~5.31）
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4. 研究创新点
（1）、首次利用利用松材线虫全基因组数据及EST数据及相关生物信息学手段搜索得到的SSR、SNP位点，利用Primer 5及Assay Design SW2.0软件设计引物并进行常规PCR扩增。选择部分不同地理来源的松材线虫单条线虫进行全基因组扩增，用以验证SSR位点多态性；
（2）、利用松材线虫DNA pool验证SNP位点多态性。SSR标记，用于松材线虫多样性分析。
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