石蒜微卫星序列通用性检测开题报告

1. 研究目的与意义

本课题利用对已完成转录组测序的红花石蒜EST-SSR序列对近缘的石蒜属的其他材料进行微卫星检测，分析其通用性。

2. 国内外研究现状分析

石蒜属植物的研究进展

摘要：针对石蒜属植物研究现状的分析和论述，从石蒜的分类、地理分布、染色体核型，光合作用、系统进化等几个方面进行了分析，并对存在的问题和研究方向进行了探讨。

abstract: forlycorisplantanalysisandtheresearchstatusquo,

3. 研究的基本内容与计划

（1）内容：本课题利用对已完成转录组测序的红花石蒜est-ssr序列对近缘的石蒜属的其他材料进行微卫星检测，分析其通用性。即通过对石蒜属选取10个种，40份材料进行微卫星的检测，分析53对引物对于石蒜属植物的通用性。并通过pcr扩增以后用ssr技术选出能够对于石蒜属大多数种能够使用的引物以方便之后的研究使用。

（2）计划：

2013年11月4日2013年11月14日，通过对二碱基合成引物、三碱基合成引物、四碱基合成引物进行比较和分析得出最终的合成引物结果，挑选出53对引物进行合成。

4. 研究创新点

（1）对于石蒜属植物的选取具有代表性，既有春出叶也有秋出叶，在同一种的选择上也分为二倍体与三倍体（如红花石蒜的二倍体与三倍体）、不同产地的情况（如红花石蒜的三倍体可分为采于学校防空洞与南京老山），在dna的提取时也对同一种材料的不同部位（如叶片与鳞茎的区别）进行了提取。种类较为齐全。

（2）在筛选合成引物时也选取了较为有代表性的通用性较好的引物进行合成。

（3）在进行pcr扩增和ssr体系试验的时候在已经经过认真挑选出来的引物中进行pcr扩增和ssr体系试验，最终挑选出能够针对石蒜属植物进行普遍性扩增成功的引物，并为今后的实验研究提供便利。