石榴果实发育FW基因及木质化途径生物信息学研究开题报告

1. 研究目的与意义

石榴是一种古老的千屈菜科落叶果树，在世界范围内广泛栽培，经济价值高，是国家规划特色经济林树种之一。

具有良好的生态适应性。

石榴可作为观赏树种，同时也具有较高的生态价值。

2. 国内外研究现状分析

石榴具有独特的胚珠分布，同时包含中轴胎座和侧膜胎座。

最近的植物胚珠生物学研究集中于胚珠发育遗传学，并发现了几个作为调节子的关键家族，如plac8家族(guo et al., 2010)。

plac8家族基因具有不同的结构和功能，涉及果实大小和细胞数量的测定，并在高等植物中重金属如镉或锌的转运中起重要作用(song et al., 2011; vietro et al., 2014)。

3. 研究的基本内容与计划

1 石榴果实发育fw基因1.1 石榴转录组从ncbi序列阅读档案(sra)数据库中选择了三个世界石榴wonderful(srr080723)，black 127(srr1054190)和nana(srr1055290)品种的转录组。

使用ngsqctoolkit v2.3.3软件进行预处理，并使用trinity v2.2.0软件进行组装。

使用transdecoder软件来预测开放阅读框(orf)。

4. 研究创新点

石榴果实发育和籽粒硬度直接影响果实品质，研究果实大小与籽粒硬度发育的遗传学背景，可以为石榴分子育种研究和发育与进化基因组学研究提供数据支持，具有一定理论创新性。

fw基因与果实发育密切相关，现阶段番茄是fw基因研究的主要目标作物，对石榴fw基因的研究尚属首次。

fw基因可作为石榴果实重量分子标记，有助于了解石榴独特的胚珠发育特征。