1. 研究目的与意义
本研究利用生物信息学,根据其余物种已报道的大量效应子的序列对樟疫霉的全基因数据库进行同源性搜索,同时对其生物信息学功能进行预测,由此挖掘出200多个rxlr候选效应子基因。
本研究借助农杆菌介导的pvx病毒表达系统,对樟疫霉中rxlr效应子avh29和avh32的生物学功能进行了初步的功能分析。
在本氏烟上瞬时表达这2个樟疫霉rxlr家族效应子,并验证了其是否对老鼠细胞凋亡前体蛋白bax或者激发子inf1引起的植物细胞死亡具有抑制作用,或者能够激发植物的免疫反应。
2. 国内外研究现状分析
据报道,樟疫霉已经造成澳大利亚西南地区森林发生结构和植物种群变化,已经严重威胁到当地自然生态系统以及生物多样性。
在中国,樟疫霉还可以危害雪松,造成雪松疫霉腐烂病 。
樟疫霉广泛分布于美洲、欧洲以及东亚、南亚和大洋洲等地区,可侵染包括林木以及农作物在内的超过3 000多种植物,是森林病害防治的重要病原菌之一。
3. 研究的基本内容与计划
3.1 研究内容3.1.1 供试烟草及供试菌株的培养供试烟草(nicotiana benthamiana)为本实验室培育。
烟草苗的培育参照zhang等(2004)的方法,待烟苗长至5叶时供试验用。
樟疫霉菌株由本实验室保存。
4. 研究创新点
本研究利用生物信息学,根据其余物种已报道的大量效应子的序列对樟疫霉的全基因数据库进行同源性搜索,同时对其生物信息学功能进行预测,由此挖掘出200多个rxlr候选效应子基因。
本研究借助农杆菌介导的pvx病毒表达系统,对樟疫霉中rxlr效应子avh29和avh32的生物学功能进行了初步的功能分析。
利用rxlr效应子对细胞死亡有没有抑制作用,能否激发植物的免疫反应。
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