樟疫霉RXLR效应子Avh22、Avh33、Avh49、Avh50、Avh145和Avh203的初步功能研究开题报告

1. 研究目的与意义

crn基因家族是卵菌中发现的一组基因，与rxlr家族类似，属于寄主胞质效应分子。

首先在致病疫霉中被报道能引起烟草的细胞死亡，并因此命名(crinklerand necrosis protein)。

本研究采用生物信息学的方法对樟疫霉家族进行了分析，表明该基因家族为卵菌所特有，且具有保守的lqlflak序列元件和hvlvvp序列元件。

2. 国内外研究现状分析

crn基因家族首先是在致病疫霉中发现的，目前对crn基因家族的研究较少，发现了许多crn基因具有干扰寄主细胞生理的功能，其中有些功能域相似，具有引起细胞死亡的活性。

之后刘廷利又发现crn基因中pscrn63和pscrn115具有独特的功能，这两个crn效应分子调控寄主的防卫反应，对致病是非常关键的。

后来刘廷利等人对大豆疫霉效应因子pscrn115的功能进行进一步的研究，采用农杆菌渗入法介导的基因瞬时转化技术在烟草上表达该基因，发现pscrn115可显著提高烟草对烟草疫霉的抗性。

3. 研究的基本内容与计划

本研究采用生物信息学的方法对樟疫霉家族进行了分析，根据其余物种已报道的大量效应子的序列对樟疫霉的全基因数据库进行同源性搜索，同时对其生物信息学功能进行预测。

借助农杆菌介导的pvx病毒表达系统，对樟疫霉中crn效应子crn2和crn3的生物学功能进行了初步的功能分析。

2017.11.20―2017.12.31：查阅文献，做好预备实验；2018.01.01－2018.02.20：提取樟疫霉菌丝基因组dna；樟疫霉crn效应子的克隆；完成载体构建。

4. 研究创新点

本研究借助农杆菌介导的PVX病毒表达系统，对樟疫霉中CRN效应子CRN2和CRN3的生物学功能进行了初步的功能分析。