福建山樱花叶绿体基因组分析开题报告

1. 研究目的与意义

了解福建山樱花叶绿体基因组的基本结构和基因序列特征。

虽然只是局限于叶绿体基因组，但是对福建山樱花的基因组研究迈出一小步，可以为日后整个基因组的研究起到一定的指引作用。

同时会从叶绿体基因组的角度，对福建山樱花的进化地位有一个初步的定位。

2. 国内外研究现状分析

虽然福建山樱花这个物种的研究尚未开始，但是在蔷薇类植物和其他植物包括裸子植物、单子叶植物和其他的双子叶植物中该类研究处于蓬勃发展阶段，测序和分析正日益增多，分析手段和方面也日益完善。

3. 研究的基本内容与计划

分析福建山樱花的叶绿体基因组，了解其基因个数和种类、编码偏好、重复序列等，进而和蔷薇类其他植物比较对其进化地位进行定位。

由于测序已经完成，所以计划从基因的注释开始，绘制圈图，之后对gc含量、密码子偏好性入手，转而分析重复序列。

接着对蔷薇类已知物种重复操作并对比分析。

4. 研究创新点

福建山樱花的基因组目前尚无人涉及，是对福建山樱花基因组探索迈出的试探性的第一步。

虽然目前手段和方法日益完善，但是仍然可以推陈出新，本次研究将采用较少使用的bi法为主要方面确定进化地位，并且进行了关于重复序列和基因结构和含量的与蔷薇类的横向比较。

更加完善而充分地完成定位，深入了解其叶绿体基因组实质。