基于D-loop序列的圆尾斗鱼遗传变异及种群分化研究开题报告

1. 研究目的与意义

圆尾斗鱼是一种著名的小型淡水观赏鱼，在当今人为干扰日益加剧的背景之下，圆尾斗鱼的栖息水域正不断丧失与破坏，其野生种群的存续需要加以关注。

遗传变异是动物适应环境变化的基础，也是开发、利用动物资源的重要条件。

为了解和评估中国圆尾斗鱼种群的遗传背景信息，该研究拟以d-loop序列分子标记，调查分析圆尾斗鱼野生种群的遗传多样性和遗传结构，以期为圆尾斗鱼的种质资源保护与开发利用提供理论依据。

2. 国内外研究现状分析

中国从20世纪80年代末至90年代初开始对斗鱼的形态结构、生活习性、产卵繁殖、胚胎发育、食物构成、灭蚊特性及生物学方面有过一些研究。

国外对斗鱼的研究起步较早，对斗鱼的研究也远比国内深入，其研究涉及到形态、生殖生理、生态、进化、行为生物学等诸多领域，并取得了可喜的成果。

但是，国内外对于斗鱼的研究，主要针对的是叉尾斗鱼或者斗鱼属的其它种类斗鱼，即圆尾斗鱼的近缘种，而对于圆尾斗鱼的研究极少。

3. 研究的基本内容与计划

研究内容：设计圆尾斗鱼d-loop 基因引物扩增无锡、镇江、黄石、淮安、铜陵等5个地理种群圆尾斗鱼基因组dna，基于扩增测序结果分析圆尾斗鱼遗传变异及种群分化。

研究计划：（1）全面地阅读相关文献，从中提炼出已有的主要研究成果，提出与本研究相对应的科学问题，阐明本研究的科学意义；（2）方案拟定：熟读分子操作指南，设计引物、提取圆尾斗鱼基因组dna、pcr扩增、送测；（3）实验数据采集与处理：测序公司发回测序结果后，使用dnastar、mega、dnasp、arlequin软件处理数据；（4）结果分析：分析圆尾斗鱼d-loop基因序列特征，圆尾斗鱼种群遗传多样性，圆尾斗鱼种群遗传结构，圆尾斗鱼d-loop单倍型系统进化；（5）得出结论：从结果出发，阐述圆尾斗鱼的圆尾斗鱼遗传变异及种群分化。

（6）附图附表：按照南京林业大学本科毕业设计（论文）撰写规范编制附图附表。

4. 研究创新点

本研究的特色与创新之处在于首次利用d-loop基因作为分子标记研究了华东地区多个区域圆尾斗鱼遗传多样性。

在现有的国内外研究中，极少有对于圆尾斗鱼遗传变异的研究。

即使有同类研究，一方面没有基于d-loop序列的研究，即另一方面，本研究将设计的基因引物扩增至无锡、镇江、黄石、淮安、铜陵等5个地理种群，相对前人研究的地理种群而言，更多且更加分散。