苦楝SSR引物筛选与遗传多样性研究开题报告

1. 研究目的与意义

目前我国对苦楝的研究还处于初始阶段，对和苦楝素含量有关的遗传基因研究，更是少之又少。

对于苦楝优良树种的培育，还存在着很大问题。

本次研究是通过运用ssr分子标记技术，对来自全国各地的苦楝样本进行引物设计，并进行扩增，找出它们之间的共同点和差别，并进行分类整理。

2. 国内外研究现状分析

苦楝作为一种生物农药的重要原材料它的种质资源在我国仍处于散生或未改良的状态,受自然选择和地理环境因素的影响遗传变异幅度较大，形成了不同地理生态类型，有着极其丰富的遗传基础，因此对苦楝这一树种的遗传信息的研究有着很大的发展空间。

目前国内也很多对苦楝表型遗传变异研究【16】王芳等人采用单因素法和正交试验设计进行ssr-pcr反应体系优化,并利用该体系以8个不同种源的苦楝基因组dna为模板,从135对候选ssr引物中进行引物筛选，成功优化了苦楝issr-pcr反应体系，筛选出15对适用于苦楝的ssr引物【17】。

廖柏勇究围绕苦楝种源地理变异规律和遗传多样性分布等问题,开展了苦楝的种源果核、种子性状、苗期和幼林期生长性状的地理变异规律研究,分析了种源间和种源内生长性状遗传变异,并基于ssr、srap标记进行了遗传多样性研究,得出苦楝种源内的变异大于种源间的变异，苦楝种源间和种源内家系间在各性状上的差异达到显著水平，以遗传距离和遗传结构分析结果为基础,结合果核、种子表型地理变异和幼林种源生长适应性分析,建议将中国苦楝分布区初步划分为3个种源区【18】。

3. 研究的基本内容与计划

试验材料选自课题组收集的38份苦楝种质资源，这些资源保存在南京林业大学白马教学基地，2018年夏季（8月份），完成收集这38份苦楝资源叶片。

基于课题组开发设计的SSR分子标记，开展苦楝种质资源遗传多样性研究研究计划：a.2018年10月，收集不同地理分布地区的苦楝种质资源（材料已经由课题组前期收集好了）；b.2018年11月-2018年12月，提取苦楝总DNA，同时基于苦楝转录组数据设计和开发苦楝SSR分子标记；c.2019年1月-2019年2月，完成SSR分子标记筛选，开展苦楝遗传多样性实验；d.2019年3月-2019年4月，完成分子标记试验结果数据分析； e.2019年4月-2019年5月，撰写毕业论文，参加答辩

4. 研究创新点

通过采用不同地理起源的苦楝种质资源，利用实验室开发和设计的SSR引物，开展苦楝种质资源筛选与遗传多样性评价，为未来开发和利用苦楝资源奠定基础。