2种秤锤树属植物的叶绿体基因组比较分析开题报告

1. 研究目的与意义

秤锤树是安息香科秤锤树属的统称，为中国特产植物，树枝叶浓密，色泽苍翠，初夏盛开白色小花，洁白可爱，秋季叶落后宿存的悬挂果实，宛如秤锤，颇具野趣，是一种优良的观赏树种，适合于山跛、林缘和窗前栽植，也可盆栽制作成盆景，具有较高的观赏价值。

部分秤锤树属植物为江苏特有的乡土树种，与外来树种相比，具有成活率高、适应力强的特点；秤锤树属植物极具特色，能更好的符合地方历史、文化特点，有独特的造园造景价值。

其经济效益、生态效益、社会效益的综合性，使得秤锤树种具有良好的开发潜力和发展前景。

2. 国内外研究现状分析

秤锤树，是安息香科（styracaceae）秤锤树属（sinojackia hu）植物的统称，由1928年胡先骕定名，为我国植物学家发表的第１个新属。

至今，秤锤树属共有7～8种1变种。

秤锤树属植物树形开展，花色洁白，果实奇特，具有较高的园林观赏价值。

3. 研究的基本内容与计划

本次研究以肉果秤锤树和细果秤锤树为主要研究对象，对它们的叶绿体基因组进行基因组组装、基因组注释、确定基因数量与类型、比较基因组分析，进而实现最大似然树和贝叶斯树构建，得到系统发育分析结果。

具体研究方案如下：(1)总dna的提取使用tiangen植物基因组快速提取试剂盒, 提取完整且纯度较高的肉果秤锤树、细果秤锤树dna。

(2)总dna测序 用超声波将dna片段化，并进行进行片段纯化、末端修复、3′端加 a以及连接测序接头；琼脂糖凝胶电泳选择片段大小；pcr扩增形成测序文库、文库质检；高通量测序平台 illumina hiseq plat-form（illumina，san diego，ca）进行测序。

4. 研究创新点

秤锤树属由于其重要的开发潜力和科研价值一直是国内外学者的重要研究对象。

此前的研究，多是对rdna序列进行测序，通过属内及属相关植物的聚类分析而确定其系统演化与分类关系，研究结果存在一定争议，仍需进一步的实验验证。

叶绿体基因组具有不进行重组和单性遗传的特点，高度保守且信息相对独立，常作为植物系统进化分析中的可靠遗传标记，在植物分子生物学研究中具有重要意义。