1. 研究目的与意义
玉米是世界上最重要的农作物之一,也是最主要的食品和饲料来源之一。
数百年来,通过自然选择、人工杂交及遗传基因的改良,人们已经获得了许多优良的高产、抗逆玉米品种。
然而,随着全球人口的迅速膨胀,人们对其产量的需求越来越大。
2. 研究内容和预期目标
研究目标 利用玉米全基因组数据搜索花药特异表达基因并对其进行功能分类,以期筛选得到与玉米雄性不育相关的基因。
研究内容:(1)玉米全基因组花药特异表达基因的筛选采用人工搜索方法,对玉米全基因组的所有基因表达模型进行检索,得到花药特异性表达基因。
(2)花药特异表达基因的功能分类利用玉米基因库maizegdb(www.maizegdb.g)对得到的花药特异表达基因进行功能分类,明确所得基因的功能。
3. 研究的方法与步骤
研究方法:(1)花药特异表达基因的获得采用人工检索方法,对玉米全基因组的超过30000个基因在数据库maizegdb中表达模型进行逐一染色体的检索,发现并对其保存以此来获得花药特异表达基因数据。
(2)花药特异表达基因的功能分类及玉米雄性不育相关候选基因的筛选对所获得的约600个花药特异表达基因进行功能分类,方法采用maizegdb(www.maizegdb.g)中对基因的功能注释进行分类,得到这些基因功能之后,进一步筛选与玉米雄性不育相关的候选基因。
技术路线1 玉米全基因组30000个基因表达模型筛选2 获得花药特异性表达基因3 基因功能分类4雄性不育相关基因筛选5 玉米雄性不育相关候选基因的获得可行性分析:作物遗传与种质创新国家重点实验室满足了本研究实验材料以及仪器设备,分析软件等。
4. 参考文献
特色或创新之处本研究立足于近年来分子生物学热门领域之一的花药花粉发育生物学,利用生物信息学相关的数据方法对玉米全基因组中花药特异表达基因进行归纳总结,发现与玉米雄性不育相关的候选基因。
5. 计划与进度安排
研究计划及预期进展2022年7月:查阅相关文献,明确实验研究背景与意义,确定实验方案;7月10月:采用人工检索方法,对玉米全基因组的超过30000个基因在数据库maizegdb中表达模型进行逐一的检索,获得花药特异表达基因数据;10月12月:对所获得的约600个花药特异表达基因进行功能分类。
2022年1月2月:进一步筛选与玉米雄性不育相关的候选基因。
2月3月:实验数据总结并撰写毕业论文。
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