水稻全基因组6mA修饰的功能分析开题报告

1. 研究目的与意义

dna是主要的遗传物质，基因组dna中的序列中包含着大量的遗传信息，这些遗传信息通过转录翻译成蛋白质而直接参与调控细胞的生命活动。

同一段dna序列在不同的环境和时期下的表达可以表现出很大的差异，并且这种差异的行为也可以在细胞分裂时遗传给子代细胞，例如来源于同一个受精卵的不同类型的细胞在形态结构和基因表达上都有很大的不同，并且这些不同的细胞还能够稳定分裂出与自身功能相同的新细胞，由此可见这种差异表达受到生物体的精确调控。

不同组织的细胞具有相同的遗传物质，而dna甲基化则是精确调控细胞特异性表达的主要途径。

2. 研究内容和预期目标

根据已公布的水稻基因组序列，以及本实验室已有的ChIP-seq数据和SMRT数据为基础，挖掘海量数据背后不同生物学过程的潜在联系，然后来探究6mA的DNA甲基化修饰的分布及其与基因表达的关系，从基因组水平解析6mA修饰的功能。

3. 研究的方法与步骤

运用表观遗传学和生物信息学的方法对已获得的ChIP-seq实验数据和SMRT数据进行分析，然后鉴定6mA修饰富集区间及6mA功能分析。

4. 参考文献

本研究利用生物信息学与表观遗传学分析方法相结合，探究6mA修饰的功能。

根据已有的测序数据研究植物中6mA修饰的分布及其与基因表达的关系，从全基因组水平解析植物6mA修饰的功能。

5. 计划与进度安排

2022年7月-8月，搜集相关文献资料了解研究方向，回顾专业相关知识，拟定论文题目；2022年9月-10月，查找阅读相关文献资料，完成毕业论文的文献综述；2022年11月-12月，完成开题报告、学习python等编程语言，掌握基本的生物信息学数据分析方法。

2022年1月-4月，将已有的chip-seq数据进行相关的流程分析。

2022年5月，撰写毕业论文。