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1. 研究目的与意义(文献综述)
1.1 选题目的
癌症是一种“不死的疾病”,很难治愈,每年都在扼杀无数人的生命。其中肺癌的发病率和死亡率增长最快,是对人群健康威胁最大的恶性肿瘤之一。数据显示,男性肺癌的发病和死亡率在所有恶性肿瘤中均为第一,女性则排第二。大量资料表明,长期吸烟与肺癌发病有着密切的关系。除此之外,随着国家工业化的发展,城市中的大气污染愈发严重,近年来许多国家报道肺癌的发病率和死亡率均有明显的升高。肺癌的相关研究也愈发的重要,不仅是临床上的治疗,更要从深入的基因层面挖掘肺癌的“秘密”。
可变剪切是前体mrna成熟过程中产生多种mrna的一种机制,由此产生的转录本将产生与单个基因功能不同的多种蛋白质。研究数据显示,约95%的具有多外显子的基因会在前体mrna成熟过程中发生可变剪切。由此可见,可变剪切在各种生理过程中起着关键性作用。越来越多的证据表明,可变剪切的失调对人类健康产生负面影响,并导致各种疾病,包括癌症、糖尿病和神经退行性疾病。特定的剪切亚型是肿瘤发生和发展的驱动因子,其与肿瘤的发生、增长、转移、生存和耐药性有关。
2. 研究的基本内容与方案
1.基本内容
首先对处理过的数据进行初步筛选,去除无差异表达的冗余可变剪切从而降低数据维度;接着用更精确的特征提取方法筛选出差异表达的可变剪切;然后将这些可变剪切作为分类特征对样本进行分类,计算分类准确率;最后对可变剪切的作用基因做富集分析,揭示肺癌的分子机制。
2.目标
3. 研究计划与安排
1—3周:阅读相关书籍,查阅有关研究论文资料,并完成一篇英文文献的翻译工作。
4—5周:根据要求完成毕业论文的开题报告,熟悉建模分析所需的软件应用。
6—8周:利用有关统计分析软件系统对数据进行统计建模分析,并得到初步结果。
4. 参考文献(12篇以上)
[1]indu jain,vinod kumar jain,renu jain.correlation feature selectionbased improved-binary particle swarm optimization for gene selection and cancerclassification[j].applied soft computing,2019,62:203-215.
[2]dara,s.,banka,h.,annavarapu,c.s.r.a roughbased hybrid binary pso algorithm for flat feature selection and classificationin gene expression data.annals of data science,2017,4:341–360.
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