利用统计学的方法识别肝癌亚型的研究开题报告

 2022-01-08 20:28:54

全文总字数:5878字

1. 研究目的与意义(文献综述)

1)研究目的及意义:

①研究的目的

肝癌包括原发性肝癌和转移性肝癌两种。近年来原发性肝癌的发病率和病死率在亚洲、非洲和西方国家有增加的趋势,且发病率在不同地域间具有明显差异。东亚的发病率最高,其次为非洲撒哈拉地区、东南亚和南欧,而北欧及美洲的发病率最低。我国是肝癌的高发国家,肝癌病例约占全球的55%,发病率和病死率均高于世界发达国家和其他发展中国家,死亡率仅次于肺癌,位居第二。严重威胁我国人民的生命和健康。目前有关肝癌的病因,演变与发展机制尚不完全清楚,主要与病毒感染、饮酒、黄曲霉素感染、超重和肥胖、饮食及社会因素密切相关,且能长期、多途径、多步骤协同作用。目前,原发性肝癌是我国常见恶性肿瘤及肿瘤致死病因,居恶性肿瘤的第5位,死亡率位居恶性肿瘤的第3位。肝癌已成为我国医学研究的重要课题,更是分子生物学及其技术应用的热点领域之一。

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2. 研究的基本内容与方案

1)研究(设计)的基本内容

本次研究的重点是如何将肝癌细胞与正常细胞区分开并进行简单且准确率高的分型。首先,因数据的样本维数高、噪声基因多等特点,需对数据进行预处理,滤除基因表达谱中含有大量的与亚型识别无效的冗余基因,同时也可以达到降维的目的。其次,基于处理后的样本集,利用主成分分析法找到特征基因以区分肝癌细胞和正常细胞;最后,利用som聚类算法从候选子集中提取基因对肿瘤细胞进行聚类,聚类结果即为肿瘤亚型。

2)研究(设计)的目标

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3. 研究计划与安排

1—3周:阅读相关书籍,查阅有关研究论文资料,并完成一篇英文文献的翻译工作。

4—5周:根据要求完成毕业论文的开题报告;并收集数据。

6—8周:利用有关统计分析软件系统对数据进行统计建模分析,并得到初步结果。

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4. 参考文献(12篇以上)

[1]付艳,邢卉春.原发性肝癌的流行状况及危险因素分析[j].中国肝脏病杂志(电子版),2014,6(02):87-90.

[2]王秀丽.基于基因芯片数据的肝癌生物信息学分析[d].南华大学,2016.

[3]杨小妹,毕育学.基于tcga数据库的lusc预后相关rnas筛选[j].临床医药文献电子杂志,2019,6(63):52-53.

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