杨柳科植物叶绿体数据库构建开题报告

1. 研究目的与意义

叶绿体是地球上的绿色植物通过光合作用把光能转化为化学能、供给地球上的其它生物能量来源的细胞器。

可以说,叶绿体是植物的养料制造车间和能量转换站。

对叶绿体的功能和叶绿体基因组转录机制的研究一直以来是全球细胞生物学家、遗传学家和分子生物学家孜孜以求的研究热点。

2. 国内外研究现状分析

1．基于基因组数据库的杂草稻叶绿体分子标记开发南京农业大学杂草研究室/江苏省杂草防治技术工程技术研究中心，使用网络基因组数据库中13份栽培水稻和野生稻叶绿体全基因组序列进行比对和分析,针对其中的高频变异区域设计标记引物,进而对60份杂草稻样品的标记区域测序并进行多态性验证。

得出结论：所开发的 3 对叶绿体分子标记可以对上述杂草稻进行良好的分类,因此可以作为研究杂草稻遗传多样性及演化的分子标记。

2．菝葜科dna条形码研究及数据库构建浙江大学邵仲达，在barcording理论和方法以及本研究室20多年对该科的世界性研究并结合世界菝葜科分类的历史的数据基础上,通过分子生物学和计算机网络技术,对菝葜科植物进行dna条形码研究和植物数据库构建。

3. 研究的基本内容与计划

一、开发工具及环境1.开发语言选用php 2．ide选择：phpstorm 3．数据库系统选择：mysql server二、系统中主要模块的设计实现根据系统的功能模块分析，系统分为前台用户查询模块和后台管理模块两大部分。

杨柳科叶绿体基因数据库是系统的核心，用户查询模块和后台管理模都是杨柳科数据库进行操作的。

对数据库的访问是系统中的主要工作，包括连接数据库、添加数据库内容、修改数据库内容和删除数据库内容等三、研究计划于2019.2.24~3.11：查阅资料，撰写开题报告和文献综述 3.12~3.26：搜集杨柳科叶绿体基因数据 建立杨柳科叶绿体基因数据库 3.27～4.17 ：制作网页，做界面的设计和布局 4.18~5.2：制作后台，完成对数据库增删改查，跟页面之间的对接5.3~5.17：完成毕业论文，准备毕业答辩

4. 研究创新点

本系统的特色是目前没有关于杨柳科的叶绿体的数据库，已经有的可视化程度不好，所以我们要借助计算机技术来搭建实用的，全面的杨柳科叶绿体数据库。

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针对杨柳科植物叶绿体数据库构建一旦构建完成，将提高我国研究人员查询杨柳科基因的效率和准确率，节约了大量的研究时间，对于我国科研人员杨柳科叶绿体基因数据的采集和分析具有重大的意义。