1. 研究目的与意义

生物信息学的研究重点主要体现在基因组学和蛋白质学两方面,具体地说就是从核酸和蛋白质序列出发, 分析序列中表达结构和功能的生物信息。生物信息学的基本任务是对各种生物分析序列进行分析, 也就是研究新的计算机方法, 从大量的序列信息中获取基因结构、功能和进化等知识。而在序列分析中, 将未知序列同已知序列进行相似性比较是一种强有力的研究手段,从序列的片段测定, 拼接, 基因的表达分析, 到RNA和蛋白质的结构功能预测。物种亲缘树的构建都需要进行生物分子序列的相似性比较。生物信息学中的序列比对算法的研究具有非常重要的理论意义和实践意义。

网站建设的目的：能够方便的比对两条dan序列，主要就是可以发现新的基因物种！可以学习的网站设计和生物信息学基础的一些知识！

2. 国内外研究现状分析

利用国际EST 数据库 和各自实验室测定的相应数据，经过大规模 并行计算发现新基因和新SNPs以及各种功能位点。

从果蝇生命开始时就永久阻止每个目标基因转录为其功能产物。国际上著名的初级核酸数据库有Genbank数据库、EMBL核酸库和DDBJ库等；蛋白质序列数据库有SWISS-PROT、PIR等；蛋白质结构库有PDB等；基因组数据库等。

3. 研究的基本内容与计划

研究从网页提交两条dna序列，对双序列进行比对并给出最终结果。序列比对的理论基础是进化学说，如果两个序列之间具有足够的相似性，就推测二者可能有共同的进化祖先，经过序列内残基的替换、残基或序列片段的缺失、以及序列重组等遗传变异过程分别演化而来。序列相似和序列同源是不同的概念，序列之间的相似程度是可以量化的参数，而序列是否同源需要有进化事实的验证。在残基－残基比对中，可以明显看到序列中某些氨基酸残基比其它位置上的残基更保守，这些信息揭示了这些保守位点上的残基对蛋白质的结构和功能是至关重要的!

第1到2周：自行了解双序列比对网站设计

第3周：撰写开题报告；

4. 研究创新点

序列搜索工具为BLAST工具，对比和发现新基因的功能更方便！界面简化，更容易操作！利用web网站设计来进行两个DNA比对，可以快速比较两个dna的相似度，可以判断基因是否属于本源！根据这个也可以发现新基因物种！