分子动力学模拟研究Thermotoga maritima的α -葡萄糖苷酶与底物的相互作用开题报告

 2021-11-05 19:16:15

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

1.1.α -葡萄糖苷酶的简介葡萄糖苷酶(glucosidase)从本质上来讲是一种糖苷水解酶,根据蛋白质晶体结构的同源性与功能的相似性,已知的糖苷水解酶可以分为133个糖苷水解酶家族(gh1-gh133)。

葡萄糖苷酶又可分为外切(exo-,从底物两端开始)和内切(endo-,从底物中间)两种,根据水解底物的方式的不同。

同时,葡萄糖苷酶也可分为α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶,因为糖苷键可以被分为α-糖苷键和β-糖苷键(糖苷键的成键方式分为α-型和β-型两种)。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

一、本课题要研究或解决的问题需要研究来源于Thermotoga maritima的α-葡萄糖苷酶与底物的相互作用关系。

二、本课题拟采用的研究手段通过分子动力学模拟酶与底物的相对运动状态,然后对轨迹进行分析,以此来研究酶与底物的相互作用关系。

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