1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)
1.1分子动力学的概念分子动力学模拟用来描述蛋白质行为的模式、强度和性质,药物受体相互作用,溶剂化在分子中,蛋白质或分子在各种条件下可能经历的构象变化,以及需要系统评估动态分子系统中分子性质的其他事件。
就在几年前,蛋白质被认为是刚体结构,构象灵活性非常有限。
然而,蛋白质是一种高度动态的结构,其内部结构是其三维空间排列和生物学功能的关键。
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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案
研究意义:掌握分子动力学工具gromacs和amber的使用方法,用gromacs研究葡萄糖氧化酶再常温和高温下的行为。
研究内容:本课题中拟利用分子动力学手段,研究葡萄糖氧化酶的序列、结构特点。
利用分子动力学模型模拟葡萄糖氧化酶的催化过程。
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