番茄RSI-1基因的克隆、表达及其生物信息学分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

本课题意义：

根是是植物繁荣的根本，与农业生产密不可分。而侧根是根系的主体，侧根原基的发生是侧根发生的基础，所以对侧根原基发生相关基因sl rsi-1的研究是极其重要的。

国内外研究概况：

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：探究sl rsi-1基因于番茄基因组中充当的角色。

内容：对sl rsi-1基因进行原核水平的转录表达，对该基因表达产物进行测序，观察sl rsi-1基因在番茄生长中根部的实时转录水平，利用生物信息学手段分析其与上下游基因的协同关系并寻找其同源基因。

拟解决的关键问题：得到测序正确的表达产物。

3. 研究的方法与方案

研究方法：实验法，文献研究法，跨学科研究法，信息研究方法

技术路线：引物设计-提取番茄总rna-rtpcr-cdna文库-dna片段-构建克隆载体-原核表达-表达产物测序-生化活性分析-生物信息学分析

实验方案：

4. 研究创新点

1.生物信息学分析。

2.运用番茄基因组测序成果。

3.本实验采用定量pcr检测生长素和β-cdh诱导番茄侧根过程中sl rsi-1基因转录水平的变化。

5. 研究计划与进展

第1周：以论文题目为核心，对相关资料进行收集和翻阅。对已搜集的资料加以整理。

第2-8周：将实验前半部分原核表达部分做完。

第4周：整合已有资料、构筑论文的大纲。