马尾松基因组SSR标记通用性检测开题报告

1. 研究目的与意义

马尾松是我国重要的工业用材和荒山造林的树种，具有很高的经济价值和生态价值。

ssr分子标记具有多态性丰富、稳定性强、共显性遗传、基因组覆盖性好和操作简单等优点，在遗传图谱的构建、基因定位、遗传多样性和物种进化分析、亲缘关系鉴定、dna 指纹图谱构建、分子标记辅助选择育种等方面有着广泛的应用前景。

本研究利用马尾松基因组测序结果开发的ssr分子标记，对松属以及近缘树种进行标记检测及分析，探究马尾松基因组开发的ssr引物的通用性，为马尾松及松属近缘属树种的相关研究提供高效多态的ssr分子标记。

2. 国内外研究现状分析

SSR标记广泛用于林木遗传多样性的检测，例如：韩骞等人利用SSR引物通用性分析杨柳科树种遗传多样性；在对SSR引物进行通用性检测发现，其在相关近缘物种中具有较高的多态性，即具有较好的通用性。

例：玉米SSR引物在高粱中应用、鹅掌楸EST-SSR在木兰科其他物种中的应用以及大豆SSR引物在豆科其他物种中的应用等都表现出较高的通用性。

3. 研究的基本内容与计划

本研究以松属及近缘树种的幼嫩针叶为实验材料，利用马尾松基因组ssr引物标记技术，统计引物在各树种的扩增成功率，分析ssr引物在各树种当中的扩增效果。

通过计算不同引物在各树种中的多态性比例等相关遗传参数和遗传相似性，进行聚类分析并筛选出多态性较高的ssr引物，并简要阐述其在林木遗传育种后续研究中的应用。

研究计划主要包括： 1. 采集相关松属以及近缘树种的幼嫩针叶置于-70℃超低温冰箱保存，然后采用ctab法提取模板dna，置于-20℃保存备用； 2.利用马尾松基因组测序结果开发的ssr引物进行pcr扩增，然后进行聚丙烯酰胺凝胶电泳并且对条带照相备用；3. 对聚丙烯酰胺凝胶电泳的结果条带进行判读，并将结果输入计算机； 4. 各树种之间相互比较，以确定ssr引物的多态性。

4. 研究创新点

利用马尾松基因组SSR标记，检测在松属及近缘属树种中中的通用性，提高马尾松基因组SSR标记的利用价值。