生长素抑制条件下富甲烷水对黄瓜基因组甲基化的影响开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

不定根（adventitious root）是一种胚后根，没有固定的生长部位，不按正常时序发生。

它常起源于植物的茎、叶柄和老根非中柱鞘组织[1]。

不定根的产生往往具有增大植物体吸收养分的面积和支持植株的功能，使细胞产生了再生能力，因此也就表现为植物的再生反应。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标与内容通过本实验，利用重亚硫酸盐测序PCR（Bisulfite sequencing PCR，BSP）方法，验证黄瓜全基因组DNA甲基化测序结果所得的关键基因位点，阐明黄瓜不定根发育相关基因启动子序列的甲基化水平拟解决的关键问题黄瓜DMP的获取；重亚硫酸盐修饰与回收全基因组DNA；BSP引物设计。

3. 研究的方法与方案

1 拟采取的研究方法及实验方案1.1材料及处理将黄瓜（cucumis sativus l.）种子经5% naclo 消毒15 min，再经去离子水冲洗45 min后，于25℃黑暗培养箱中培养约2 d。

待黄瓜根长长至1 cm时，转移至光照培养箱培养。

取不同时间的黄瓜进行进一步处理，从3个单株混合取样，提取全基因组dna。

4. 研究创新点

DNA甲基化在植物发育中的相关研究还知之甚少。

而本实验运用BSP法鉴定黄瓜不定根发育相关基因启动子序列的甲基化水平，具有十分重要的意义。

5. 研究计划与进展

2017年9月-2017年12月：寻找黄瓜不定根相关dmp，设计bsp引物。

2017年12月-2018年4月：提取黄瓜全基因组dna，进行bsp甲基化检测，鉴定不定根发育相关的黄瓜dna甲基化位点。

2018年4月-2018年5月：数据汇总整理并进行综合分析，课题总结并试着撰写论文。