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1. 研究目的与意义

1研究的目的和意义

转录组的概念由VelculescuVE.等首先提出。它是指某个物种或特定的组织、细胞产生的所有转录本的集合，包括可以行使编码作用的mRNA和一些非编码RNA，是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带。转录分析可在整体水平上提供特定条件下基因的表达信息，是目前使用最广泛基因表达调控手段。根据转录组分析结果，可推断相应相应基因的生物学功能，揭示特定调节基因的作用机制以及在特定的生物学过程或特定疾病发生过程中的作用机理，广泛应用于基础研究，临床诊断和药物研发等领域。高通量转录组学研究技术主要包括基于杂交技术的表达谱芯片技术和基于测序技术的转录组测序技术。其中基于测序技术的RNA-Seq转录组分析具有高通量、低成本、快速、准确的特点，已成为转录组分析的基础技术。学习和开展二倍体植物的转录组分析具有很多重要的实用价值和现实意义。

2. 国内外研究现状分析

2文献综述

2.1转录组研究前沿

在人类基因组计划的完成后想当长的一段时间内，科学家逐渐认识到对基因结构的研究只是基因组学研究的一部分，不能解释所有的生物学问题。随着转录组学、蛋白质组学、代谢组学等组学的不断涌现，生物学研究已经跨入后基因组时代。转录组学是功能基因组学研究的重要组成部分，是一门在整体水平上研究细胞中所有基因转录及转录调控规律的学科。广义的转录组代表细胞或组织内全部的rna的转录本，包括编码蛋白质的mrna和各种非编码rna（rrna、trna等），而狭义的转录组系指所有编码蛋白质的mrna的总和。

2.2转录组研究历史

随着科学家们对蛋白质组的深入研究，他们发现依靠单一的蛋白质组数据是不能清楚地获得鉴定基因的功能，而将转录组研究的信息用于印证蛋白质组研究结果会非常有效。同时，上世纪90年代中期大规模应用于基因表达水平研究的微阵列技术也推动了转录组学在生物学研究中的发展，使其成为生命科学研究的热点。其次，科学技术的不断发展产生了新一代的测序技术高通量测序技术，此技术在转录组研究中的应用使得转录组研究提供的数据量数倍扩增，拓宽了转

3. 研究的基本内容与计划

3研究方案

从公共数据库获得特定二倍体植物的转录组测序原始数据

（1）与参考基因组比对统计

（2）基因表达水平研究

4. 研究创新点