前噬菌体基因在猪链球菌不同菌株中的分布研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1. 本项目的研究意义猪链球菌是一种革兰氏阳性兼性厌氧的球菌，多呈球状或者短链状，在液体培养物中链比较长，一般由815个球菌排列成链状，无鞭毛，无芽孢，不运动，无两级着色的现象。

根据荚膜抗原的不同，分为33个血清型（1-33型，1/2型）[1,2]。

其中2型则是临床上感染猪和人最多的血清型。

2. 研究的基本内容和问题

1. 研究目标本实验准备对120株不同猪链球菌菌株中的前噬菌体进行鉴定，从中筛选出含有前噬菌体样元件的菌株，进一步研究猪链球菌不同菌株前噬菌体的分布。

根据菌株的毒力因子与毒力强弱和前噬菌体基因的分布进行比较，试分析其是否存在一定联系。

2. 研究内容① 查阅相关资料，并下载猪链球菌不同菌株的全基因序列（自行测序和网上公布）、不同菌株的毒力因子分布和毒力强弱。

3. 研究的方法与方案

1. 研究方法① 下载猪链球菌基因组序列，利用生物信息学软件分析前噬菌体基因。

② 比较不同菌株的前噬菌体，寻找同源性较强的片段设计引物③ 对实验室的120菌株进行检测前噬菌体分布。

④ 分析比较不同菌株前噬菌体分布和毒力因子以及毒力强弱的关系。

4. 研究创新点

本实验的创新之处1. 充分利用生物信息学技术和各大生物网址的分析工具以及数据库，分析前噬菌体基因，从而对其分布进行探究。

2. 前噬菌体与毒力关系目前还没有得出准确的结果，并且前噬菌体基因与其致病性的关系还尚未有人进行研究。

5. 研究计划与进展

1.研究计划第一阶段（1个月） 分析并设计猪链球菌前噬菌体基因引物第二阶段（3个月） 检测不同来源前噬菌体基因的分布，测序并对结果进行分析第三阶段（2个月） 撰写论文2.预期进展①通过生物信息学分析，找到前噬菌体基因片段，成功设计出引物。

②通过pcr对实验室保存菌株扩增，成功找出前噬菌体基因的分布。

③发表相关文章