1. 研究目的与意义
研究背景
d-木糖是木质纤维素的重要组成成分。
目前对d-木糖的生物法利用主要集中在将其转化为木糖醇，或作为酵母发酵生产二代乙醇的原料，化学法利用则是将其转化为糠醛类化合物。
将d-木糖异构化为d-木酮糖可对其进一步异构化或还原、氧化制备稀有糖产物，具有广阔的应用前景。
2. 研究内容和预期目标
研究内容：本课题的主要研究目标为D-木糖导向的D-核糖-5-磷酸异构酶B的结构重新设计，通过可视化分析其三维结构，依据多种因素选定候选突变点库，构建虚拟突变体的三位结构，并通过对接、分子动力学模拟和QM方法进行氢键、极性/非极性相互作用和能量分析，构建多个位点间的作用网络，以提高其对木糖的活性。
预期目标：通过研究其内部残基间的协同作用、与底物的结合作用及其与催化中心之间的作用和途径，探索多样化结构与醛酮糖异构酶底物特异性的对应关系，揭示OsRpiB中对底物识别具有显著的影响的关键位点及其对底物的识别机制，阐明PBS对酶催化过程的调控方式和途径，为创制特异性制备稀有糖的生物催化剂提供理论基础。3. 研究的方法与步骤
本课研究采用的方法为虚拟突变(virtual mutagenesis)，同源建模(homology modeling)和分子对接(molecular docking)。主要步骤包括：
一、分子建模采用swiss- model服务器（http://swissmodel.expasy.org/），通过序列搜索获得覆盖率和相似度较高的模板，以该模板产生三维结构，对所产生结构的评价采用拉氏图进行，对所产生结构的优化采用moe软件中的amber ff10力场进行。
二、可视化分析采用pymol、vmd和chimera等软件完成。
4. 参考文献
| [1]m.w. iqbal, t. riaz, s. mahmood, k. ali, i.m. khan, a. rehman, w. zhang, w.mu, areview on selective l-fucose/d-arabinose isomerases for biocatalyticproduction ofl-fuculose/d-ribulose, int. j. biol. macromol. 20201,(168):558–571
剩余内容已隐藏，您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容！
5. 计划与进度安排1）2024-12～2024-02：查阅文献资料，撰写开题报告。
2）2024-02～2024-03：通过可视化分析选取突变位点，实施虚拟突变，并建立突变体的三维模型。
剩余内容已隐藏，您需要先支付 10元 才能查看该篇文章全部内容！立即支付
课题毕业论文、开题报告、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。 您可能感兴趣的文章最新文档
联系我们加微信咨询 
加QQ咨询 
服务时间：09:00-23:50(周一至周日)
|
