1. 研究目的与意义
本课题研究的背景
胰腺癌概述
胰腺癌是一种消化系统恶性肿瘤,也是全球死亡率最高的癌症之一。仅在欧盟每年就有超过40000人死亡。胰腺癌唯一有效的治疗方法是手术,但即使经过手术和辅助化疗,生存率也仅有30%。胰腺癌早期阶段通常无明显症状,确诊时通常已经扩散,因此预后较差,患者5年生存率仅为5%。
2. 研究内容和预期目标
研究内容:
本文将全面检索公共基因表达芯片数据库,对多套胰腺癌样本-正常样本的表达谱进行荟萃分析,寻找到高度可信并且可重复的胰腺癌相关基因,并将这些基因映射到基因功能、分子通路,在系统水平分析这些基因的调控功能网络和模块。我们还将验证不同数据集的重要分子特征在通路水平的相似性高于基因水平的相似性这一假设。
(1) 基因表达芯片数据的收集以及预处理;
3. 研究的方法与步骤
方法
(一)根据论文题目,查阅相关文献。
包括正式出版的中外学术期刊和专著。从中选择20篇以上重点参考文献认真阅读,综合分析,写出文献综述方法,概括出最新研究进展与存在问题。在上述基础上,完成论文开题报告。
4. 参考文献
[1][1] Xu, L., D. Geman, and R.L. Winslow, Large-scale integration of cancer microarray data identifies a robust common cancer signature. BMC Bioinformatics, 2007. 8: p. 275. [2][2] Cahan, P., et al., Meta-analysis of microarray results: challenges, opportunities, and recommendations for standardization. Gene, 2007. 401(1-2): p. 12-8. [3][3] Rhodes, D.R., et al., Large-scale meta-analysis of cancer microarray data identifies common transcriptional profiles of neoplastic transformation and progression. Proc Natl Acad Sci U S A, 2004. 101(25): p. 9309-14. [4][4] Fundel, K., et al., Normalization strategies for mRNA expression data in cartilage research. Osteoarthritis Cartilage, 2008. 16(8): p. 947-55. [5][5] Rao, Y., et al., A comparison of normalization techniques for microRNA microarray data. Stat Appl Genet Mol Biol, 2008. 7(1): p. Article22. [6][6]Hua, Y.J., et al., Comparison of normalization methods with microRNA microarray. Genomics, 2008. 92(2): p. 122-8.
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5. 计划与进度安排
本论文的各阶段安排为:
1、2022-03-1~2022-03-09 接受任务,按照指导教师要求查阅资料,撰写开题报告
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