番茄抑病型土壤可培养细菌群落特征研究开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

实验室的长期田间定位试验点结果表明，利用生物有机肥能够有效调控土壤微生物区系，构建出抑病型土壤微生物区系，进而防控番茄青枯病。然而已有的针对此抑病土壤的研究均建立在分子生态学的层面上，而可培养微生物的获得对更深一步的研究至关重要。因此本研究以此抑病型土壤为模型，分离筛选其可培养微生物，并分析此抑病土壤可培养微生物群落特征。

研究进展：

抑病型土壤指即使存在一定数量的病原菌，依然不发病或者发病不严重的土壤。国际上已有研究指出，发病土壤经过长期连作，会获得免疫土传病害的能力，微生物群落的演变及关键功能微生物的激发是土壤获得抗性的基础。然而国际上针对抑病型土壤的研究均主要基于高通量测序和单菌株的拮抗效果验证。然而抑病土壤与感病土壤微生物群落差异并不仅限于个别菌株，因此针对抑病土壤微生物的研究仍需进一步深入。

2. 研究的基本内容和问题

研究目标：

分离筛选番茄抑病土壤中的可培养细菌，探究可培养细菌的群落特征。

研究内容：

3. 研究的方法与方案

研究方法：

可培养微生物分离：限制稀释法、菌株培养、平板划线、菌种保藏；

菌种鉴定：pcr法、高通量测序、16s扩增子测序、qiime2、mega；

4. 研究创新点

特色或创新之处

（1）已有关于抑病土壤的研究主要基于生物信息学分析和单菌验证。而对微生物群落的进一步研究需要大量可培养微生物的支撑，因此本研究对抑病土壤所有可培养微生物进行分离筛选并构建资源库，对未来的研究至关重要。

（2）抑病型土壤指可以抵御土传病害的土壤，对抑病型土壤的研究可以为绿色农业中土传病害的防控提供理论支持。抑病型土壤的抑病能力主要由其中的微生物群落所支提供，因此，了解抑病型土壤中微生物群落的形成，以及对相应微生物群落物种多样性、功能多样和关键微生物的研究有利于人们理解抑病型土壤中微生物。

5. 研究计划与进展

研究计划

2020年12月——2020年01月：对抑病土壤根际微生物进行分离；

2020年01月——2020年03月：对培养得到的微生物进行建库测序；