分子生物学鉴定在污染底泥分离的微生物鉴定与分类中的应用开题报告

全文总字数：891字

1. 研究目的与意义

淮河的养殖区已经受到了一定程度的污染，水产品的质量有所下降对人体健康和生态环境造成威胁。

将从淮河的养殖区取底泥样品，分离相关微生物进行特性研究。

从而可以提出一系列的方案措施，改善淮河养殖区的水质，提高水产品质量，还人们卫生健康。

2. 国内外研究现状分析

6种dna提取方法对于二代测序结果的影响主要体现在otu 丰度和菌种相对数量上，磁珠法和试剂盒法（溶菌酶处理）的 otu 数最接近真实数量，无杂质 otu；通过 pcr 扩增检测动弯杆菌的方法,灵敏度与特异度要比通过涂片gram 染色镜检或动弯杆菌纯培养的方法高。

用混合培养物的 dna 作模板,利用动弯杆菌特异性引物进行 pcr扩增,经琼脂糖凝胶电泳分 析,可以检测动弯杆菌的存在，结合 dna 测序分析, 则可以进一步确定检测结果并推断所属的种。

biolog 微生物自动鉴定系统能利用计算机进行数据分析，自动化和标准化程度高，鉴定范围大、速度快，目前已成为微生物分类鉴定常用的技术手段。

3. 研究的基本内容与计划

16s r rna gene扩增及测序技术在细菌的鉴定与分类研究中发挥着越来越重要的作用。

本研究就16s r rna gene结构、可变区和保守区部分序列来鉴定从污染底泥分离的微生物。

淮河的养殖区已经被大量抗生素污染已对水产养殖产业以及对水产品消费者造成健康威胁。

4. 研究创新点

在微生物生态学研究方面，以过去的群落结构分析为基础 ,今后将对以功能基因为基础的群落结构进行分析 ,特别要通过研究功能基因在自然环境中的表达调节 ,以弄清微生物在环境中的真实的状态。

在进行这些微观解析的同时 ,也应该进一步了解物理的、化学的环境因子 ,以及高等生物与微生物之间的相互关系。

相信 ,随着各种方法学的进一步完善 ,我们将会逐渐了解到自然生态环境中微生物群体多样性及实际的生存状态。