梨CRP基因家族收集与鉴定开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

课题意义：在植物有性生殖中，花粉萌发和花粉管生长对成功的受精有重要的影响。

在授粉时，花药携带着花粉到达雌蕊处然后再水化。

然后通过顶端生长，花粉管生长到达胚珠。

2. 研究的基本内容和问题

研究的目标和内容：crp的鉴定hmm的逐次迭代和blastp检索用来鉴定梨中小的crp。

一组在之前鉴定出来的hmm(silverstein, moskal et al. 2007)用来扫描梨基因组以得到完整的defl基因，用在第一步中得到的完整的defl基因通过blastp发现defl基因的片段。

crp基因的基因组序列所有的defl基因和基因片段固定在染色体上，其他的在不同的支架上(wu, wang et al. 2013)。

3. 研究的方法与方案

研究方法：crp的鉴定我们的检索策略是基于逐次迭代的hmm建立和blastp相似性搜索来检索梨crp基因(altschul, madden et al. 1997; silverstein, graham et al. 2005)。

我们用之前鉴定的516个crp建立的hmm来检索所有预计的梨的多肽(wu, wang et al. 2013)。

这些主要的模型只由覆盖广泛的uniprot蛋白质数据库中的来自成熟的多肽的crp、基因组研究所的33种植物基因目录和拟南芥与水稻的全部基因组(silverstein, moskal et al. 2007)。

4. 研究创新点

创新之处：目前在国内关于此蛋白的功能研究还依然处于起步阶段，对其深入的研究将具有较高的科学理论意义和应用价值。

由于梨的有性生殖对果树产业的重要性，在此范围内对CRP进行鉴定和进化分析具有一定的意义。

5. 研究计划与进展

研究计划：初期得到CRP基因组然后验证得到数据库最后进行进化分析