菊花扦插生根能力的变异及其分子标记的关联分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1.本研究的目的意义菊花(dranthdma morifium)为菊科多年生宿根草本植物，原产于我国，是我国传统十大名花之一，其神韵清奇、绚丽多姿，具有很高的观赏价值。

作为我国栽培史上最悠久的名花，菊花以其色彩清丽、姿态高雅、香气宜人而深为我国人民所喜爱，并被广泛栽培。

扦插是菊花的主要繁殖方法，对菊花的加速繁殖具有重要意义[1]，是菊花规模化生产的最优繁殖途径[2]。

2. 研究的基本内容和问题

1.研究目标、内容和拟解决的关键问题1.1研究目标（1）明确菊花扦插生根的遗传变异规律；（2）鉴定出扦插生根能力强的菊花品种；（3）发掘与菊花生根变异能力显著关联的分子标记。

1.2研究内容本研究拟以代表性切花菊品种自然群体为研究对象，采用穴盘扦插，一个月后进行与扦插生根能力相关性状的统计获得表型鉴定数据。

利用srap 、ssr等分子标记技术分析切花菊生根能力、群体结构和连锁不平衡水平，在此基础上基于全基因组关联分析挖掘菊花扦插生根能力相关性状的分子标记或优异等位变异位点。

3. 研究的方法与方案

2 研究方法、技术路线、实验方案及可行性分析2.1研究方法采用随机区组方法进行田间试验设计；采用形态学观察法并结合统计方法鉴定生根变异能力；采用适用于菊花的改良ctab法提取基因组dna；用srap、ssr等分子标记进行全基因组分子标记扫描，获得大量的分子标记数据；采用excel和spss软件进行表型性状基本描述性数据处理；采用popgene、ntsys和treeview 软件进行遗传多样性研究；采用structure 2.2和tassel 3.0等软件进行群体结构和标记连锁不平衡分析；采用tassel 3.0的mlm程序进行分子标记与生根能力变异强弱的关联分析。

2.2技术路线2.3实验方案2.3.1 田间实验设计与表型性状鉴定以保存在南京农业大学菊花种质资源保存中心里的切花菊自然群体81个品种为材料。

按照随机区组设计进行田间试验，每个品种从每个小区随机选择5株统计平均根长、最长根长，根粗，根数，根鲜重、根干重等重要反映生根能力性状，重复区组试验，进行平均值及变异系数等基本描述性数据统计。

4. 研究创新点

3．本项目的创新之处3.1 研究内容的创新以往关于菊花扦插生根能力的研究主要集中在外界的环境因子如基质材料和配比、生长素处理、光质等方面，而内在因素的研究则集中在插穗的长短、从母株获取部位、插穗的营养状况等方面的探索，其结果存在一定的局限性。

本研究拟开展复杂数量性状的分子遗传研究，研究内容新颖。

3.2 研究手段和方法的特色本研究拟定的数量性状相关分子标记挖掘将采用试验周期短、精度高、研究群体遗传范围广的关联分析法进行，该方法是目前主要作物和部分园艺植物数量性状分子遗传研究的有效手段。

5. 研究计划与进展

4. 项目研究计划及预期进展（1）2013.12-2014.3，查阅相关资料、文献，积累相关知识，为今后开展实验奠定坚实的理论基础。

（3）2014.4-2014.5，进行扦插实验，并统计根长、根粗、根数以及根鲜重和干重等相关性状的表型数据。

（4）2014.6-2014.12，利用srap和ssr的多态性引物对所有研究材料进行全基因组分子标记扫描。