葡萄芽休眠相关基因的表达分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

1.研究意义

葡萄在我国果树生产中具有举足轻重的地位，与香蕉、柑橘、苹果、梨和桃等并称为我国六大水果。2007年我国葡萄栽培面积和产量分别为43.8万公顷669.7万吨，分别占全国果树栽培面积和产量的4.2%和6.4%，且最近几年，种植面积也一直呈现扩大的趋势。2008年全国葡萄栽培面积和产量分别达到了45.13hm2和715.15万t，葡萄栽培面积和产量均居世界第5位。按鲜食葡萄产量，我国已连续多年高居首位(罗国光,2007)。葡萄生产已成为农村经济的重要组成部分。此外，与多年生木本果树显著不同的是，葡萄的童期较短，而且一年可以多次开花结果，这些特点使得对葡萄的研究有着重要的意义。

休眠使果树芽避开不利的环境条件，而在适宜的环境条件下得以萌发，休眠芽对环境条件的抵抗力强，能在恶劣的季节中存活下来，表现为一种十分重要的适应性，通过这种适应性物种得以不断生存、发展和进化。芽的休眠特性不仅对物种的保存、繁衍方面具有特殊的生物学意义，而且在农业生产中特别是果树的设施栽培中具有重要的经济意义。

2. 研究的基本内容和问题

二、研究的目标、内容和拟解决的关键问题

1.研究目标

本课题旨在通过分析转录组数据，通过基因克隆，qrt-pcr和序列比对及进化分析等方法，研究芽休眠相关基因在不同器官，组织中的表达谱，为进一步分析芽休眠的相关基因以及系统性地解释葡萄芽休眠的系统奠定基础。

3. 研究的方法与方案

(1)同源基因的查找

首先在ncbi数据库中搜索查找桃、苹果、拟南芥等芽休眠相关基因的蛋白质序列，然后下载并且保存为fasta格式。然后利用blastp程序中进行同源蛋白质的查找，获取葡萄芽休眠相关基因氨基酸序列。最后在ncbi数据库中寻找葡萄芽休眠相关基因的dna序列，点击保存为fasta格式，命名为葡萄芽休眠相关基因dna序列。

(2)转录组数据挖掘

4. 研究创新点

运用生物信息学手段，已完成对葡萄全基因组中芽休眠相关基因的查找与鉴定，运用转录组数据挖掘、序列比对分析、RT-qPCR等方法，系统分析芽休眠相关基因在不同器官组织中时空表达特性。

5. 研究计划与进展

计划从2015年6月开始，研究进展如下：

2015.06-2015.07对已有文献报道进行整理，完成文献综述，了解近期葡萄芽休眠进展以及进行同源基因的查找

2015.08-2015.09葡萄材料选择与准备

2015.09-2015.10从实验室已有的葡萄芽不同时期转录组数据进行挖掘