基于基因组的梨慢速阴离子通道（SLAC）基因家族分析开题报告

1. 研究目的与意义、国内外研究现状（文献综述）

梨为世界主要水果，深受消费者青眯，世界栽培梨果的国家约有76个。

梨栽培品种可分为东方梨(又称亚洲梨)和西洋梨两大类。

东方梨主要产于中国、日本、韩国等亚洲国家，包括砂梨( pyrus pyrifolia nakai)、白梨( pyrus bretschneideri rehd. )和秋子梨(pyrus ussuriensis maxim. )等；西洋梨主要产于欧洲、美洲、非洲和大洋州等，主产国有美国、意大利、西班牙、阿根廷等。

2. 研究的基本内容和问题

一、研究目的：鉴定梨中的SLAC基因家族成员，并且鉴定梨慢速阴离子通道SLAC以及功能调控分析。

二、研究内容：1、鉴定梨中的SLAC基因家族成员2、对各SLAC成员基因的进化关系分析3、鉴定梨气孔保卫细胞质膜上起调控作用的SLAC基因三、拟解决的关键问题： 不同物种间的序列变异，检索的的基因序列不是全长序列，会影响同源序列的引物设计和扩增。

3. 研究的方法与方案

一、研究材料：提取梨不同组织RNA，SLAC基因二、研究方法：1、利用生物信息学方法收集已知的SLAC基因2、利用RT-PCR分析SLAC在梨各组织中的基因表达情况3、数据库预测梨SLAC基因各表达蛋白的主要结构域功能 三、研究手段： 基因数据库检索，RT-PCR技术，基因序列的生物信息学分析四、技术路线：见附件

4. 研究创新点

通过成功绘制的梨的基因组序列，研究了梨SLAC基因家族的鉴定和调控功能分析。

本研究第一次鉴定了梨的SLAC基因家族成员，并且探明了详细的进化和表达特性，并与拟南芥SLAC家族做比较。

5. 研究计划与进展

一、研究计划：2016年3月 检索slac同源序列。

2016年3月 收集代表性品种的梨叶、花、果、根组织，提取梨rna。

2016年4月 对收集的slac基因做生物信息学分析，设计slac基因扩增引物。