利用miR-RACE确定生物信息学预测的葡萄的vvi-miR172精确的序列开题报告

 2022-01-26 10:56:11

1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)

到目前为止,植物中mirna数以百计的被报道,这些mirna中很大一部分是用生物信息学方法预测的。

然而,与编码蛋白质的基因有起始密码子和终止密码子相比,mirna分子的两端没有任何特征可以用来确定mirna成熟体序列,这使生物信息学方法预测mirna往往不能确定成熟的mirna在前体中的精确位置。

利用mir-race生物信息学预测的葡萄的mir172精确序列。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

2. 研究的基本内容和问题

利用miR-验证了葡萄中生物信息学预测的葡萄的miR172精确序列的精确序列。

进一步利用RLM-5 RACE来验证miR172对其靶基因的剪切和荧光定量RT-PCR来研究精确序列的表达。

3. 研究的方法与方案

葡萄的幼叶、嫩茎、根、花芽、花和果(直径0.50 cm)的提取参照第二章,葡萄和苹果总rna提取用的是改良的ctab法(李志强等, 2008),小分子rna的富集参照第二章用4m的licl。

小分子rna定量与完整性检测, → ploy(a)小分子rna 5 接头的连接 → cdna第一链的合成→mir-5 race和mir-3 race扩增,→mirna172目的片段的回收,→目的片段与载体的连接,→目的片段的转化及克隆鉴定,→荧光定量pcr检测新的mirna。

葡萄mir-5race和mir-3race为了扩增葡萄mirnas的5末端和3末端,我们构建了葡萄根、茎、叶、花和果混合样的小rna mirna文库(图3-2a, fu et al., 2005),扩增5和目标mirna的3端,用类似于类似的cdna末端快速扩增(race)技术的mir-5race和mir-3race 分别扩增mirna的5末端和3末端。

剩余内容已隐藏,您需要先支付后才能查看该篇文章全部内容!

4. 研究创新点

据我们所知,没有系统全面的方法,以确定这些miRNA的精确序列。

我们开发了一个综合性的实验方法,结合了小RNA cDNA文库的构建(Song et al., 2010),miRNA的5RACE和3RACE来扩增miRNA的两个末端以及RACE产物的克隆测序。

5. 研究计划与进展

2016年3月份采样,2016年4-5月份试验2016年5月份毕业论文撰写

剩余内容已隐藏,您需要先支付 10元 才能查看该篇文章全部内容!立即支付

课题毕业论文、开题报告、任务书、外文翻译、程序设计、图纸设计等资料可联系客服协助查找。