1. 研究目的与意义、国内外研究现状(文献综述)
一直以来,杂交育种都是人类提高农作物产量和品质的主要技术,而杂交障碍的主要原因之一就是雌雄配子体的有效识别。
因为不具备动物精子的游动能力,在开花植物中,花粉降落到雌蕊柱头后,可与雌蕊发生相互作用。
在亲和的情况下,花粉在柱头上可以水合、萌发、生长。
2. 研究的基本内容和问题
研究目标:(1)收集并鉴定梨prk家族基因,构建系统发育树,分析亚家族建的系统发育关系和进化方式;(2)分析梨prk基因组基因的复制模式和梨prk之间的线性关系;(3)分析家族基因进化过程中的选择压力和相对分化时间;(4)prk6基因的克隆,在梨各组织中的表达分析,亚细胞定位。
研究内容:本研究以拟南芥prk为参照,基于同源性检索和结构域鉴定收集并鉴定梨prk家族基因,构建系统发育树并对它们进行亚家族划分,对家族基因进行复制模式、染色体定位、基因间线性关系的分析,计算所有梨prk基因之间的ka/ks值并分析prk基因对之间ka/ks值。
并以砀山酥梨花粉为试验材料,克隆梨prk6基因,进行组织特异表达分析,验证基因的亚细胞定位,为梨花粉管导向机制研究奠定基础。
3. 研究的方法与方案
研究方法:1、生物信息学分析 利用现有的生物学软件以及梨数据库进行基因的搜索,从而确定在梨里面的相似基因,对这些相似基因进行系统发育树的构建、亚家族的分类、基因复制模式和线性关系分析、ka/ks分析。
2、基因的克隆 以砀山酥梨的花粉cdna为模板,通过neb网站设计的pbrprk6.1和pbrprk6.2的引物进行基因的克隆。
3、基因在不同组织中的表达分析 利用rt-pcr从砀山酥梨根、茎、叶片、果肉、花粉、花柱以及子房7个不同组织中分析pbrprk6.1和pbrprk6.2基因的表达情况;并以q-pcr进行验证。
4. 研究创新点
开花植物的受精过程存在着各种机制,不论是自交不亲和或亲和,试图建立一个统一的授粉过程机制模式一直都未成功。
有研究表明,植物通过许多方式排斥自身的花粉,但也有可能以多种方式接受亲和的花粉并引导精细胞进入胚囊。
直至现在为止,还没有建立一个完全明了的亲和机制理论系统,但有几个系统的某些方面显示花粉管的导向是发生在雌蕊中的,其中一些机制涉及到蛋白和糖原。
5. 研究计划与进展
研究计划2017年7-2017年8月,梨prk家族基因的收集与鉴定,系统发育树的构建。
2017年9-10月,梨prk家族基因复制模式、染色体定位、基因间线性关系研究以及ka/ks计算。
2018年11-12月,克隆潜在的梨prk6基因。
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