mLST8基因和RPTOR基因的多态性位点与癌症相关性的荟萃分析开题报告

全文总字数：5100字

1. 研究目的与意义（文献综述）

近几年来，雷帕霉素在哺乳动物细胞中的靶标复合物1(mtorc1)已被认为是许多细胞必需生命过程的重要调节位点，并且有研究者发现这一复合物的功能失调会造成癌症的发生。复合物中的mtor是磷酸肌醇-3激酶(pi3k)-akt信号途径的关键下游物，它对细胞的代谢、增殖、迁移、凋亡和血管生成等生命活动具有调节作用。除了mtor之外，mtorc1复合物还包括mlst8、rptor、deptor和pras40四种调节相关蛋白，其中的mlst8和rptor蛋白质可以对mtor起到正调节作用，这两类蛋白均具有蛋白缔合作用。rptor与mtor形成化学计量络合物并能在营养刺激的s6k1信号转导、保持细胞大小和mtor蛋白的表达中发挥作用，而mlst8可以与mtor的激酶结构域结合从而调节mtor的激酶活性。这些证据表明mlst8基因和rptor基因可能是癌症发生的两个重要候选基因。单核苷酸多态性（snp，single‐nucleotide polymorphism），是目前定义明确的一个分子生物标志物，已广泛应用于重大疾病遗传易感性的预测。目前， rs26865和rs3160多态性位点（mlst8基因），以及rs3751932和rs3751934多态性位点（rptor基因）被大量研究去探寻它们在影响个体癌症发生易感性中的作用。

yu等研究者发表在中华病理学杂志上的文章研究了mtorc1的基因多态性位点与结直肠癌风险的关联性，他们的研究结果发现研究人群中mlst8基因rs26865位点为aa基因型时与癌症发生风险存在负相关性，而rptor基因的rs3751934位点为gg/cg基因型时，研究人群中的患癌风险同样会有所下降。另一篇发表在journal of thoracic oncology杂志的文章中，作者对mtorc1的基因多态性与食管鳞状细胞癌的相关性进行了研究，结果发现研究人群中的mlst8基因rs3160和rs26865位点与rptor基因的rs3751934和rs3751932位点与此类癌症的发生并无良好相关性或存在较高的预测误差。2013年发表于molecular carcinogenesis杂志的一篇研究mtorc1基因多态性与胃癌相关性的论文的结果显示mlst8基因rs3160和rs26865位点与rptor基因的rs3751934和rs3751932位点的单基因座突变与胃癌的发生并无明显的统计学联系。刘颖春在2014年发表的硕士学位论文研究了mtorc1基因多态性与肝癌的遗传易感性之间的关联，该研究通过对1048例肝癌患者与1052例非肿瘤患者的取样调查，研究结果发现mlst8基因rs3160和rs26865位点与rptor基因的rs3751934和rs3751932位点在显性模型和隐形模型的条件下均未发现与肝癌发生风险之间有统计学意义的关联性，但在对基因位点间的联合作用分析时发现具有多个危险基因型个体罹患肝癌的风险是携带单个危险基因型个体的1.53倍。

上述多篇文献的研究结果由于样本容量、统计方法和样本人群的不同，对mlst8基因与rptor基因的多态性位点与不同癌症间的关联性缺乏统一性的认识和结论，这就需要一种研究方法来对这些独立的研究进行关联性评估并做出系统性评价。通过对相关研究文献进行荟萃分析，进一步研究基因组的基因位点对癌症风险的关联性是筛选、预防和治疗癌症的一个有效的研究方向。本研究拟以mlst8基因的rs26865和rs3160多态性位点，及rptor基因的rs3751932和rs3751934多态性位点为研究对象，通过对这四个多态性位点和癌症发生的相关性进行荟萃分析，为将来对mtorc1的深入研究提供线索和方向。

2. 研究的基本内容与方案

(1)基本内容与目标

通过查阅检索研究rs26865、rs3160、rs3751932和rs3751934位点与癌症相关性的文献，取得每一个位点在这些研究中的基因分型情况。利用生物信息软件对这些位点与癌症之间的关联性进行荟萃分析。

通过检测rs26865、rs3160、rs3751932和rs3751934位点在癌症人群中的分布情况，通过比例数据来分析这些位点的基因型为致癌作用所提供了的遗传风险因素，并提供相应的癌症患病率的估计。

（2）拟采用的技术方案

3. 研究计划与安排

第1周：调研阅读文献，准备开题；

第2-4周：完成开题报告，熟悉和掌握本课题所涉及到的生物信息学网站的基本情况和使用方法；

第5-13周：检索和下载mlst8基因（rs26865和rs3160位点）及rptor基因（rs3751932和rs3751934位点）与癌症发生相关性研究的文献。运用endnote文献管理器管理文献，提取各研究中的rs26865、rs3160、rs3751932和rs3751934四个位点的基因分型数据，汇总后运用stata软件进行荟萃分析。

4. 参考文献（12篇以上）

[1] jing he, meng-yun wang, li-xin qiu, mei-ling zhu, et al. genetic variations of mtorc1 genes and risk of gastric cancer in an eastern chinese population[j]. molecular carcinogenesis, 2013, 52(s1):70-79.

[2] shao j, li y, zhao p, et al. association of mtor polymorphisms with cancer risk and clinical outcomes: a meta-analysis[j]. plos one, 2014, 9.

[3] xu yiquan,huang yina,weng lihong,zheng jiankun,huang yi,lin ying,zhao yunan,li hongru,chen yusheng. effects of single-nucleotide polymorphisms in the mtorc1 pathway on the risk of brain metastasis in patients with non-small cell lung cancer.[j]. journal of cancer research and clinical oncology,2020,146(1).