mTOR基因多态性位点与癌症易感性的荟萃分析开题报告

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1. 研究目的与意义（文献综述）

tor基因是于1991年在酵母在酵母作为雷帕霉素靶蛋白被发现的，与酵母tor结构和功能相应的哺乳动物tor被称为mtor。哺乳动物雷帕霉素靶蛋白（mammalian target ofrapamycin,mtor）是一种非典型的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶。mtor作为一种重要的信号传导分子，可通过整合细胞外信号，影响基因转录与蛋白质翻译，在维持细胞生长、增殖、分化和凋亡等功能中起中心调控作用。近年来mtor基因在正常发育和疾病发生发展过程中的生物学功能受到越来越多的关注。

mtor在人体内以2种复合物的形式存在：与raptor蛋白形成复合物，称为mtoer-raptor复合物（mtorc1）;与rictor蛋白形成的复合物，称为tor-rictor复合物（mtorc2）。mtor信号通路是细胞内最重要信号通路之一，mtorc1和mtorc2这两种复合物参与细胞基因转录、蛋白质翻译起始、核糖体生物合成、细胞凋亡等过程。此外，目前研究表明，mtor信号通路调控异常与肿瘤的发生和发展密切相关，许多人类恶性肿瘤如乳腺癌、结肠癌、前列腺癌、卵巢癌、淋巴癌、肺癌及肝癌等均伴有mtor通道异常。

近年来，关于mtor上几个snp功能位点对癌症易感性的影响的研究越来越多。xu等的研究结果显示mtor启动子区多态性rs2295080与胃癌风险显著相关，携带t等位基因的个体要比携带g等位基因的个体患胃癌的概率高23个百分点huang等研究发现rs2536位点tc基因型可以降低中国儿童急性淋巴细胞性白血病的发病风险。he等研究发现rs1883965位点a等位基因能增加患胃癌的风险，尤其在分层分析中rs1883965位点的ag、aa基因型对有吸烟史的人群作用更明显。zhu等的研究发现rs1883965位点a等位基因能增加患食管鳞状细胞癌风险。然而并非所有结果都一致显示相关性，如刘颖春、毛良勤等人的研究结果并未发现几个snp位点在各层间与肝癌发病风险有统计学关系，而赵涵等在研究mtor基因多态性rs2295080位点与非贲门胃癌的发病风险相关性时，也发现两者没有关系。

2. 研究的基本内容与方案

(1) 研究内容与目标

基本内容：通过查阅检索，搜索查找 mtor 基因 rs2295080、rs2536 和 rs1883965 位点与癌症相关性的资料文献，收集病例对照研究中 rs2295080、rs2536 和 rs1883965 位点的基因分型情况，分析其等位基因、不同人群中的频率分布并利用生物信息网站预测其可能存在的功能。对掌握的数据进行荟萃分析，评估分析统计结果，通过分析数据显示的癌症相关性，提供这些位点与癌症相关性的基本评估。

研究目标：通过荟萃分析的方式，汇集多个研究中提供的信息数据，从不同人群、不同地域等多方位层面分析 mtor 基因rs2295080、rs2536 和 rs1883965 位点与癌症相关性，为将来 mtor基因与癌症相关性的进一步研究提供线索和方向，同时也有利于针对性地对特定癌症进行分析研究。

3. 研究计划与安排

第1周：调研阅读文献，准备开题；

第2-4周：完成开题报告，熟悉和掌握本课题所涉及到的生物信息学网站的基本情况和使用方法；

第5-13周：检索和下载mtor基因rs2295080、rs2536和rs1883965位点与癌症相关性研究的文献。运用endnote文献管理器管理文献，提取各研究中的rs2295080、rs2536和rs1883965位点的基因分型数据，汇总后运用stata软件进行荟萃分析。

4. 参考文献（12篇以上）

[1] chen, j., shao, p., cao, q., li, p., li, j., cai, h., yin, c. (2012).genetic variations in a pten/akt/mtor axis and prostate cancer riskin a chinese population. plos one, 7(7), e40817.

[2] he, j., wang, m. y., qiu, l. x., zhu, m. l., shi, t. y., zhou, x. y.,wei, q. y. (2013). genetic variations of mtorc1 genes and risk ofgastric cancer in an eastern chinese population. mol carcinog, 52 suppl1, e70-79. doi:10.1002/mc.22013

[3] huang, l., huang, j., wu, p., li, q., rong, l., xue, y., . . . fang, y.(2012). association of genetic variations in mtor with risk of childhoodacute lymphoblastic leukemia in a chinese population. leuk lymphoma,53(5), 947-951. doi:10.3109/10428194.2011.628062