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1. 研究目的与意义（文献综述）
长非编码rna（lncrnas），其长度范围为200bp至100kb，是一种新型的调控性非编码rna。虽然lnc rnas没有开放的阅读框架和潜在蛋白质翻译的能力，但是在不同的生理和病理状态下具有不同的功能，在不同水平上调节基因表达，包括染色质修饰，转录和转录后处理。许多证据表明lncrnas在细胞内稳态、增殖及凋亡等过程中发挥作用，参与了肿瘤的发生发展。一些lncrnas（如：h19和meg3）已被证实作为原癌基因或抑癌基因在癌症过程中发挥作用。
单核苷酸多态性（snp，single nucleotide polymorphism），是目前定义明确的一个分子生物标志物，已广泛应用于重大疾病遗传易感性的预测。snp rs3787016位点是在高加索人群的全基因组关联研究中，新发现的前列腺癌风险位点。rs3787016位点位于rna聚合酶ii多肽e（polr2e）的第四内含子基因中。polr2e是一个lncrna，编码rna聚合酶ii亚基，负责合成信使rna。近年来，在内含子中发现了越来越多的新的致病性snp位点，其中一些已经被报道与异常剪接过程有关。研究报告称，大多数lncrna是由rna聚合酶ii转录的，其亚基可能受到polr2e的影响。此外，snpnexus数据库预测了rs3787016位点可能调节polr2e基因的剪接过程。因此，rs3787016位点可能通过调节polr2e基因的剪接过程，产生功能失调的polr2e，从而影响正常细胞lncrnas的转录特征，从而增加癌症的风险。
前期研究显示，polr2e基因 rs3787016 位点与前列腺癌、食管癌、乳头状甲状腺癌、乳腺癌和宫颈癌和肝癌的易感性显著相关，表明 rs3787016 位点可能影响个体癌症发生的遗传易感性。同时有研究结果显示polr2e基因 rs3787016 位点与肝癌和肺癌的发生不相关，这些不一致的研究结果显示单个关联对照研究仍存在不足之处，如样本量小导致的统计力度不强，完全解释该位点与癌症易感性的相关性的能力有限。此外，有些结果没有进行功能评估，应该在更大规模的跨人群调查中得到证实，最后，由于癌症风险可能受到多种环境因素例如基因与基因和基因与环境相互作用的影响，polr2e基因可能与不同种族和不同环境相关风险因素暴露下的不同程度的遗传风险有关。
2. 研究的基本内容与方案
（1）研究内容与目标
基本内容：通过检索polr2e基因的rs3787016位点与癌症的相关研究，收集病例对照研究中rs3787016位点的基因分型有效数据，并对基因中聚合酶 ii 多肽 e(polr2e)中的 rs3787016 位点进行荟萃分析，开展此位点在不同人群中与不同癌症的发生风险的关联研究。
目标：荟萃分析聚合酶 ii 多肽 e(polr2e)中的 rs3787016 位点在不同癌症中的基因分析数据，分析聚合酶 ii 多肽 e(polr2e)中的 rs3787016 位点与不同癌症的易感性的关联。
3. 研究计划与安排
第1周：调研阅读文献，准备开题；
第2-4周：完成开题报告，熟悉和掌握本课题所涉及到的生物信息学网站的基本情况和使用方法；
第5-13周：检索和下载polr2e基因的rs3787016位点与癌症相关性研究的文献。运用endnote文献管理器管理文献，提取各研究中rs3787016位点的分型数据，汇总后运用stata软件进行荟萃分析。
4. 参考文献（12篇以上）
[1] f. bray, j. ferlay, i. soerjomataram, r.l. siegel, l.a. torre, a. jemal, global cancer statistics 2018: globocan estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries, ca cancer j clin, 68 (2018) 94-424.
[2] b. chen, j. li, c. yi, y. jiao, x. gu, x. feng, long non-coding rna
polr2e rs3787016 is associated with the risk of papillary thyroid carcinoma in chinese population, pathol res pract, 214 (2018) 1040-1044.
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