鹅掌楸种间差异表达基因的克隆开题报告

1. 研究目的与意义

本研究利用已发现的LT098种间特异性扩增DNA片段，寻找、克隆鹅掌楸属种间差异表达的同源基因。通过对所得片段的序列比对，进行结构分析、功能预测及同源分析。

2. 国内外研究现状分析

胥猛、李火根（2008）从dbest数据库检索到9531条北美鹅掌楸花器官的est序列，最后成功设计176对est-ssr引物，lt098引物就来源于此176对引物中。

张红莲、李火根等（2010）以不同种源的鹅掌楸、北美鹅掌楸和不同组合的杂交鹅掌楸为试验材料，对176对ssr引物（xu et al.，2006）进行初筛、复筛，最后筛选出一对鹅掌楸物种特异性ssr引物，即lt098引物。

根据李红英等（2011）的研究成果可知，lt098引物在木兰科其它部分属内不仅有扩增产物，而且还具有多态性，个别属的种内也存在多态性。

3. 研究的基本内容与计划

本研究利用已发现的lt098种间特异性扩增dna片段，采用北美鹅掌楸、鹅掌楸的花芽材料，运用rt-pcr和race相结合的方法寻找、分离、克隆鹅掌楸属种间差异表达的同源基因。然后利用生物信息学手段对所得片段进行序列比对，分析其核苷酸和氨基酸序列差异，并对其编码的蛋白质进行结构分析和功能预测，同时通过ncbi在线比对进行同源分析。

本课题从3月份开始，到6月份结束。具体计划如下：

2012年3月上旬 文献阅读及研究方案的确定

4. 研究创新点

本研究首次利用鹅掌楸属种间特异性DNA片段来寻找差异表达的同源基因。