基于系统生物学标记语言（SBML）的生物网络构建及分析开题报告

1. 研究目的与意义

1、熟悉系统生物学标记语言（sbml）；2、了解各种类型网络的特征属性；3、掌握生物网络的构建方法及常规软件的使用；4、构建复杂疾病网络，明确致病关键基因/蛋白；5、明确常见中药材-疾病关键基因/蛋白-疾病表型的关联性；阐明常见中药材之间、药材与复方之间以及复方与复方之间对疾病治疗作用的异同点。

最终，基于sbml语言，建立基于生物网络的治疗复杂疾病中药材及复方的分子药理机制搜索系统，有利于要从中医中药理论出发，研究和阐明中药药理作用的思想。

当今系统生物学有大量的信息，需要有一个全面、有效、方便的工具来提供研究所需要的信息。

2. 国内外研究现状分析

复方是中医用药的主要形式，以中医药理论为指导，运用现代科学手段，对古方和现代经验方进行多指标的系统药理研究，可以在更深的层次揭示方剂的治疗原理，有效地指导临床用药和中药新产品研创。

近年来，中药复方在药效学、药代动力学和分子药理研究等方面取得了较好的进展。

近年来，数据库知识（knowledge discoveryin database，简称kdd）技术在中药化学成分与药效方面的研究日益增多，其中潜在的知识为复方药效物质的化学结构信息与机制的研究开拓了新的视野。

3. 研究的基本内容与计划

1、系统生物学标记语言；2、生物网络的构建方法及常规软件；3、复杂疾病致病关键基因/蛋白；4、中药材-疾病关键基因/蛋白-疾病表型的关联性。

大体时间计划：3月学习生物学标记语言的用法，生物网络的构建方法及常规软件；4月学习需要的相关生物学知识，了解复杂疾病致病关键基因/蛋白、中药材-疾病关键基因/蛋白-疾病表型；5月具体构建基于生物网络的治疗复杂疾病中药材及复方的分子药理机制搜索系统；如果有剩余的时间，就检查系统的不足并进行修补，尽量做得更好、更完善。

4. 研究创新点

1、使用SBML，方便与其他生物学研究人员交流、学习；2、用生物网络的概念构建复杂疾病致病关键基因/蛋白、中药材-疾病关键基因/蛋白-疾病表型的关系网络方便研究使用。