碧桃不同花色转录组间SNP的发掘与分析开题报告

 2021-08-08 23:46:07

1. 研究目的与意义

碧桃(prunus persica),又名千叶桃花,蔷薇木、蔷薇科、桃属植物,碧桃是桃的一个变种,习惯上将属于观赏桃花类的半重瓣及重瓣品种统称为碧桃。

碧桃的花期为3月至4月,较梅花花期长,花朵丰腴,色彩鲜艳丰富,花型多。

碧桃树干高可达8米,小枝红褐色,无毛。

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2. 国内外研究现状分析

碧桃(prunus persica),为蔷薇科李属植物,起源于中国,在我国及世界上都是重要的经济树种和观赏树种,世界各地均有栽植。

目前国内外对碧桃不同花色转录组间snp分子生物学的研究已有不少。

在我国,早在1991年,北京林业大学的张秀芳教授对北京市的桃花资源进行了调查研究,观察与记载了26个品种。

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3. 研究的基本内容与计划

研究内容   以同一植株上的红白花瓣为材料,通过对其rna进行罗氏454测序,通过查阅以往关于枣树研究资料的基础上,利用生物信息技术对其转录组核苷酸的变化进行分析,如单核苷酸突变(snps),插入与缺失(indels)等情况进行分析研究,并参照已有的研究资料进行理论分析计划(1)认真收集了解相关资料,熟悉各种试验器材的使用,在试验前准备相关的资料和方案,严格按照说明进行实验操作。

(2)认真学习相关生物学信息分析软件。

(3)分析数据结果并得出结论

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4. 研究创新点

虽然以往关于碧桃的研究已有一定的研究基础,但目前关于转录组水平的的核苷酸变化还未曾报道,因此本研究的结果将为后期遗传标记的开发、种质资源的研究、多态性分析、基因定位等研究奠定一定的理论基础,并为碧桃后续的分子水平研究工作发掘一定的创新思路研究。

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