几株芽孢杆菌生物学特性的研究开题报告

1. 研究目的与意义

芽孢杆菌是一种革兰氏阳性，产芽孢的，好氧或兼性厌氧的杆状细菌。

芽孢杆菌是开发生物农药，是微生物肥料的重要菌种来源。

芽孢杆菌与植物的相互作用长期以来是微生物研究的焦点领域之一。

2. 国内外研究现状分析

目前国内外都有微生物方面的研究者在致力于微生物新种的发现及鉴定工作，其中，Int J Syst Evol Microbiol杂志是国际上关于微生物新种鉴定的权威性期刊，而国内的，如南京农业大学的何健教授就发表过关于A synthetic pyrethroids(SPs)-degrading bacterium isolated from activated sludge in a SPs-manufacturing wastewater treatment facility 和A novel anilofos-degrading bacterium isolated from a wastewater treating system 等具有降解农药的细菌的发现与鉴定的文章。

3. 研究的基本内容与计划

本次课题中我们主要采取的是对16s rrna 和gyrb 碱基序列进行分析并构建系统发育树为主要手段，该途径也是目前证实可信度较高且国内外主流的分类依据。

同时辅助对样品进行一些试验性的生理生化分析，对分类加以验证的同时探究其具有的对植物生长特定的帮助作用。

课题所采用的样本是来自于哈尔滨某火山遗址主要实验步骤有：1、提取7株样品的dna，通过pcr扩增16s rrna 片段和gyrb 片段并进行基因测序。

4. 研究创新点

由于大多数细菌的16srrna有着高度保守的特性，在不同的种属内仅有些许碱基的差异，而这种差异性的高低对于判定两株菌株的物种相似度有着很高的参考价值。

然而由于16s rrna 高度保守的特性，在许多属内种间相似度甚至达到98.1%-99.8%，所以仅凭16s rrna 也常常无法区别相近种。

所以我们继续对菌株的gyrb基因序列进行测序分析，由于其同样具有保守性和变异性的特质，且变异度高于16s rrna，所以其序列分析可用于相似种之间的分类鉴定。