樟疫霉自噬相关基因的鉴定及其表达规律研究开题报告

1. 研究目的与意义

樟疫霉（Phytophthora cinnamomi）属于卵菌门（Oomycota）、卵菌纲（Oomycetes)、霜霉目（Peronosporales）、腐霉科（Pythiaceae）、疫霉属(Phytophthora)。经研究表明，疫霉是半活体寄生的病原菌，在侵染前期阶段营活体营养，侵染后期营死体营养，同样是半活体营养的植物病原菌 M.grisea 和 U. maydis，细胞自噬在其侵染阶段起非常重要的作用，ATG基因的敲除导致病菌致病能力明显降低。

2. 国内外研究现状分析

樟疫霉是一种危害极高的病菌，尽管已知其基因组序列，但是目前国内外对其研究较少。细胞自噬在各类高等真核细胞中均有重要地位，目前有关细胞自噬的研究多见于医学、药学领域，这些领域的研究也为植物病害相关菌物的研究提供了参考，研究细胞自噬相关基因的表达规律有利于人们更深入了解病菌的特性，从而有针对的提出解决病害的方案。在细胞自噬的机制与检测领域的研究已经取得了一系列成果，但如何利用这一系列成果治理病害房门的研究尚待进一步深入。

3. 研究的基本内容与计划

1、数据分析

樟疫霉、大豆疫霉、橡树疫霉、致病疫霉的全基因组数据已经全部测序完成并公开，将四种疫霉的基因组数据下载并本地化。

选取模式物种人 （homo sapiens）、秀丽隐杆线虫（caenorhabditis elegans）、拟南芥（arabidopsis thaliana）、酿酒酵母 （saccharomyces cerevisiae）和稻瘟菌（magnaporthe grisea），通过 genbank获得模式物种的atg蛋白氨基酸序列。

4. 研究创新点

本课题通过对比模式物种、分析数据库等方法，获得樟疫霉自噬相关基因的序列，采用荧光定量PCR技术对比樟疫霉生活史各个阶段ATG基因的表达规律，在基因层面上探究细胞自噬相关基因的表达对植物病原菌的影响，由此可以利用基因表达的相关特性得到对该类病原菌物的防控办法，为今后相关研究提供参考。