基于SNP位点的安徽省虫株种群遗传分析开题报告

1. 研究目的与意义

松材线虫病，即松树萎蔫病，是一种引起松属树种毁灭性死亡的世界性森林病害。该病具有致死快、传播蔓延迅速、对松林威胁大等特点。松材线虫分布于世界上多个国家，包括东亚的中国、日本、韩国和朝鲜，北美洲的加拿大、美国和墨西哥，欧洲的葡萄牙等。1982年，我国在南京中山陵的黑松上发现了松材线虫，在短短的30多年，疫区范围扩大到江苏、浙江、安徽、福建、江西、山东、湖北、湖南、广东、广西、四川、重庆、贵州、云南等15省区市，不仅给国民经济造成巨大损失，也导致了生态功能及自然景观的破坏，同时也对我国松林资源产生了严重威胁。

面对松材线虫的严重威胁，近几年政府来加强了松材线虫病的预防和除治工作其主要防治措施有：①严格封锁疫区周边数百米范围以内的林区；②通过焚烧或使用化学试剂等方式对疫区林木砍伐的树桩和病株进行严格处理；③在夏末和秋季对感病树木上的天牛幼虫喷洒螟松乳剂；④培育抗性品种或利用松褐天牛、松材线虫的天敌进行防治，如花绒寄甲、管氏肿腿蜂等；⑤加强检疫，严控带病林木向外运输，防治病害的扩散等。

通常情况下，大部分的入侵物种会由于新环境胁迫、遗传漂变等因素产生相应的适应性进化，从而表现出较原产地种群在遗传多样性明显降低和遗传结构存在差异的现象。再者，松材线虫与近缘种的种间遗传变异较大，松材线虫内的遗传变异却很小。目前，大多数的研究都很少涉及松材线虫种内的遗传变异及遗传多样性的方面。

2. 国内外研究现状分析

目前，用于遗传多样性检测的方法主要有四种，分别是：形态学标记、细胞学标记、生化学标记和分子标记。如今，人们已研究出很多分子标记法来检测松材线虫。主要包括三大类：

①基于杂交的分子标记方法：限制性片段长度多态性；

②基于pcr扩增技术的分子标记方法：一种是随机扩增多态性dna技术和采用特定引物或引物对扩增的标记，包括scar，小卫星dna，微卫星dna，又称为简单重复系列等。二是pcr与酶切相结合的方法，主要指aflp，即pcr-rflp方法。

③基于dna序列和基因芯片技术的分子标记方法：如单核苷酸多态性。

3. 研究的基本内容与计划

研究内容：通过安徽省松材线虫虫株的采样、分离与纯化，采用ctab法提取各纯化线虫虫株的基因dna，接着分析测序结果来验证snp位点。

研究计划：

2017.09-2018.03 安徽省松材线虫疫区疫木的采集、分离、鉴定与纯化

4. 研究创新点

目前，大多数的研究都很少涉及松材线虫种内的遗传变异及遗传多样性的方面，因此有必要开展对松材线虫的种群遗传学的研究。本课题通过SNP分子标记方法分析了安徽省份的松材线虫虫株的遗传多样性，探讨不同地域（县级）松材线虫的亲缘关系及变异，为研究防治松材线虫的工作有重要的指导意义。