薄壳山核桃品种鉴别分子标记开发开题报告

1. 研究目的与意义

近几年，我国大力推广薄壳山核桃产业的发展，目前我国市场上主栽的薄壳山核桃品种有50多个。

一般栽植五到六年后才能挂果，然而在幼苗期很难从形态上进行品种辨别，因此一旦误用不当或采用伪劣品种造林，影响深远。

分子标记技术可以从dna分子水平上精确而有效地鉴定薄壳山核桃的品种。

2. 国内外研究现状分析

由于薄壳山核桃的商品价值极高，国内外学者展开了大量的研究，主要包括薄壳山核桃的容器育苗和嫁接技术、薄壳山核桃营养成分的研究、薄壳山核桃无性系开花物候及花粉特性等，而品种鉴定是这些研究中必不可少的一部分。国内外主要采用ISSR分子标记技术对薄壳山核桃品种鉴定和亲缘关系分析，但存在检测较为繁琐，结果不稳定的情况。

3. 研究的基本内容与计划

主要研究内容：

根据已经测序的薄壳山核桃基因组序列，采用primer3设计ssr引物1000对，收集薄壳山核桃中的优良品种并提取dna，随即选用两个品种dna用琼脂糖凝胶电泳进行引物初步筛选；初步筛选能扩增出条带的引物，随即选取6个品种dna，用聚丙烯酰胺凝胶电泳筛选多态性引物；计算多态性引物的pic指数，选择pic指数大于0.5的引物用于薄壳山核桃品种的鉴别。最后采用多态性引物对收集的薄壳山核桃品种进行dna指纹图谱的构建，选出适用于薄壳山核桃品种鉴别的最少引物组合。

研究计划：

2018.12-2019.1：收集与该研究相关的资料，明确研究内容与方法。

2019.3-2019.5：根据基因组序列设计ssr引物，分别采用琼脂糖凝胶电泳和聚丙烯酰胺凝胶电泳进行多态性引物筛选；收集目前国内推广使用的优良品种，采用筛选的多态性引物，进行dna指纹图谱的构建。

2019.5-2019.6：全面分析、综合所得数据，撰写论文。

4. 研究创新点

目前，常用的分子标记技术有RFLP、RAPD、ISSR、AFLP、SSR、SNP等分子标记。本研究选用SSR分子标记技术，因为SSR在薄壳山核桃基因组中随机均匀分布，变异丰富，而且同一个物种中获取的微卫星引物在近缘种间有较强的通用性。其次该技术具有共显性、多态性高、 遗传稳定、重复性好、操作简单等优势，相比较于其他分子标记技术，性价比更高。