检查神经酰胺的多肽适配体设计研究开题报告

 2023-07-07 08:22:16

1. 研究目的与意义(文献综述包含参考文献)

一、简介神经退行性疾病主要包括阿尔茨海默病,帕金森病,亨廷顿病,脊髓损伤,中风,肌萎缩性侧索硬化症,额颞痴呆和病毒疾病,它们主要是由神经退行性过程引起的,并且与语言障碍,性格改变,痴呆和进行性肌肉无力有关。

慢性或急性神经退行性疾病都与高发病率和高死亡率有关,伴随着大脑不同区域神经元死亡,几乎没有有效的治疗方法。

年龄是这些疾病最大的危险因素,这些疾病是导致老龄化社会的健康问题和生活质量问题的主要原因。

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2. 研究的基本内容、问题解决措施及方案

解决的问题:通过对神经酰胺适配体的设计和筛选,找到与神经酰胺结合特异性最强的rna适配体,并以该rna为识别元件,实现对神经酰胺的超灵敏检测。

研究手段:先用python随机生成长度为29的字符串作为rna序列;再用vienna rna package生成rna序列的二级结构。

然后通过rosetta package根据rna的序列和二级结构获得rna的三级结构;接着用薛定谔(schrdinger)软件对rna和神经酰胺进行对接计算及打分;最后,计算rna与神经酰胺的结合自由能,通过结合自由能来判断rna与神经酰胺结合的程度。

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