1. 研究目的与意义
结直肠癌（colorectalcancer，crc）是常见的人类消化道恶性肿瘤，其易发部位按照发病率从高到低依次为直肠、乙状结肠、盲肠、升结肠、降结肠及横结肠，近年有向近端（右半结肠）发展的趋势。结直肠癌发病与生活方式、遗传、大肠腺瘤等关系密切，其发病年龄趋老年化，男女比为1.65：1。结直肠癌早期无症状，或症状不明显，仅感不适、消化不良、大便潜血等。随着癌症的发展，症状逐渐出现，表现为大便习惯改变、腹痛、便血、腹部包块、肠梗阻等，伴或不伴贫血、发热和消瘦等全身症状。结直肠癌因其发病部位不同而表现出不同的临床症状及体征。肿瘤因转移、浸润可引起受累器官的改变。全球结直肠癌每年新发病例数约120万，年病死人数超过60万，发病率居第3位，病死率居第4位。近些年，结直肠癌的发病率呈明显上升趋势。因此，结直肠癌的治疗一直是国内外学者研究的热点。治疗结肠癌常采取手术切除为主的综合治疗方案。Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ期患者常采用根治性的切除 区域淋巴结清扫，根据癌肿所在部位确定根治切除范围及其手术方式。奥沙利铂联合氟尿嘧啶类药物（5-氟尿嘧啶）的方案是目前iii期结直肠癌和部分具有高危因素结直肠癌患者的标准治疗方案，治疗时间为6个月。适用于术前未接受新辅助放射治疗的直肠癌患者，术后需要进行辅助放射治疗者。化疗药物包括5-氟尿嘧啶、卡培他滨、奥沙利铂、伊立替康、贝伐单抗、西妥希单抗、帕尼单抗等多种药物，常用化疗方案有：folfox、xelox、folfiri等，在化疗基础上酌情联合靶向药物治疗（贝伐单抗、西妥希单抗、帕尼单抗）。
基因芯片（又称dna芯片、生物芯片）技术系指将大量探针分子固定于支持物上后与标记的样品分子进行杂交，通过检测每个探针分子的杂交信号强度进而获取样品分子的数量和序列信息。基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上，可以一次性对样品大量序列进行检测和分析，从而解决了传统核酸印迹杂交（southernblotting和northernblotting等）技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足。基因芯片作为一种先进的、大规模、高通量检测技术，应用于疾病的诊断，其优点有以下几个方面：一是高度的灵敏性和准确性；二是快速简便；三是可同时检测多种疾病。
了解结直肠癌发病的相关分子标记，将有助于我们掌握肿瘤的临床进展行为和患者对药物的反应。
2. 研究内容和预期目标
本文将全面检索公共基因表达芯片数据库，对多套结直肠癌样本-正常样本的表达谱进行荟萃分析，寻找到高度可信并且可重复的结直肠癌相关基因，并将这些基因映射到基因功能、分子通路，在系统水平分析这些基因的调控功能网络和模块。我们还将验证不同数据集的重要分子特征在通路水平的相似性高于基因水平的相似性这一假设。
通过本课题的研究，我们将力争实现以下研究目标：
3. 研究的方法与步骤
1.检索各大基因表达谱数据库如arrayexpress（http://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/）和geneexpressionomnibus(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)，收集结直肠癌基因表达芯片的数据。
2.整理芯片信息，选取结直肠癌症不同的样本进行对照的芯片信息，进行下一步分析。
3.采用多种差异基因表达分析软件，包括most，ort，copa，os等，分别针对每一组芯片数据寻找出在不同期癌症样本中差异表达的基因。
4. 参考文献
[1]xu,l.,d.geman,andr.l.winslow,large-scaleintegrationofcancermicroarraydataidentifiesarobustcommoncancersignature.bmcbioinformatics,2007.8:p.275.
[2]cahan,p.,etal.,meta-analysisofmicroarrayresults:challenges,opportunities,andrecommendationsforstandardization.gene,2007.401(1-2):p.12-8.
[3rhodes,d.r.,etal.,large-scalemeta-analysisofcancermicroarraydataidentifiescommontranscriptionalprofilesofneoplastictransformationandprogression.procnatlacadsciusa,2004.101(25):p.9309-14.
5. 计划与进度安排
1、2022-03-1～2022-03-09接受任务，按照指导教师要求查阅资料，撰写开题报告
2、2022-03-10～2022-03-23进行数据收集，熟悉相关程序软件，数据的的预处理等。
3、2022-03-24～2022-04-06不同统计方法寻找差异基因的效果比较；择优采用统计算法选出结直肠癌不同期间差异表达基因；
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