肺癌中谷胱甘肽过氧化物酶基因家族功能的生物信息学研究开题报告

1. 研究目的与意义

1.1研究背景

1.1.1癌症的危害

癌症是人类健康的主要威胁之一，目前的癌症治疗方法未能根除癌症。随着现代人类社会和全球经济的发展，癌症已成为威胁人类健康和主要死亡原因之一。根据世界卫生组织国际癌症研究机构（iar）发布的2020年全球最新癌症负担数据，统计了全球185个国家的三十余种癌症类型的病发率、死亡情况和癌症的发展趋势。其中显示2020年全球癌症新发病例大约1929万例，其中男性占1006万例，女性占923万例。而作为世界第一的人口大国，中国的癌症新发人数远超世界其他国家，人数占全球的23.7%。

2. 研究内容和预期目标

2.1主要研究内容

gpx参与调节细胞周期、细胞信号转导等一系列重要的生物学过程。gpx可催化氢过氧化物生成水或相应醇类的还原反应，与其他还原反应不同的是该还原反应以谷胱甘肽作为还原剂，清除体内的过氧化氢及其他的过氧化物，进而维持机体正常的生理功能和延缓衰老。肿瘤细胞和正常细胞之间最大的差别就是前者大量生成活性氧，并且降低去除活性氧的功能。长时间的持续氧化应激增强了肿瘤细胞氧化dna损伤，同时癌细胞快速增殖和迁移并逃避凋亡。基于此，本课题的研究内容为gpx家族基因的收集、表达模式的分析、与肺癌的预后相关性分析等；预期研究目标为揭示gpx在肺癌中的表达差异及其与患者生存时间的相关性，了解gpx基因在肺癌中的作用，以便于进一步研究gpx的作用机理。

3. 研究的方法与步骤

3.1收集gpx家族相关基因

在ensembl网站搜索收集gpx家族相关基因，下载蛋白质序列以进行基因序列分析。

3.2进化树分析

4. 参考文献

[1] wang r, su q, yin h, etal. inhibition of srsf9 enhances the sensitivity of colorectal cancer toerastin-induced ferroptosis by reducing glutathione peroxidase 4 expression[j].the international journal of biochemistry cell biology, 2021: 105948.

[2]程峰,张庸,王祥,窦晋涛,吴志浩.谷胱甘肽过氧化物酶gpx4在铁死亡中的作用与机制研究进展[j].现代肿瘤医学,2021,29(07):1254-1258.

[2]张军,王硕,孟繁杰,严一杰,王斌,关志宇.谷胱甘肽过氧化物酶在肿瘤中作用的研究进展[j].癌症,2019,38(06):282-287.

5. 计划与进度安排

1、第17周（20-21-1学期）-第3周（2022年12月28日--2022年3月21日）：根据和导师讨论确定的论文题目，大量阅读文献，其中选择10篇以上参考文献（外文1-2篇或以上）进行深入阅读，参照任务书写出开题报告。选择一篇外文（5000字以上，文献内容要结合本研究内容）进行全文翻译。

2、第4周（2022年3月22日--2022年3月28日）：在充分调研文献的基础上，制定实验具体实施计划，进行试验研究的前期准备工作；